次のジムをめざし旅を続けるサトシたち。
砂漠を越えればあと一歩でアサギシティーだー！！と思いきや、その砂漠で立ちふさがるのは、またもやピカチュウをねらってやってきたロケット団。ドガーズに対抗し、サトシが持ち出したのはヒノアラシだった。 だが、大変なことにドガーズの煙幕に、ヒノアラシの火炎が引火して大爆発！！あれれ？一瞬にしてヒノアラシがきえてしまった！？ヒノアラシを探しながらポケモンセンターによったサトシ達は、そこでポケモンの傷を癒すといわれる不思議なオアシスの話を耳にする……。