第5話「激突!!ソニックvsナックルズ」
2003年5月4日放送
ソニックたちと別れ、単独行動を取っていたナックルズは街に身を潜めていた。そこへDrエッグマンが接触してきて「自分はカオスエメラルドを集めて元の世界に戻そうと思っている。今までの悪事はわびるからソニックをやっつけてくれ」と訴えた。ナックルズはその言葉に騙された。そのとき、正体不明の宝石が発見されたとの報道。実はエッグマンの企てた罠なのだがソニックたちと、ナックルズは向かった。そこでソニックとナックルズの対決が始まった。しかし決着はなかなかつかず、業を煮やしたエッグマンがメカで大暴れ。