自分の力をコントロールできないアイガ。アキレスとの共鳴を高めようと特訓するが、アキレスが思うように動いてくれない。少しでも気晴らしにと、動物たちと遊んで気分転換しようとするが、アイガの黒いオーラに動物たちも逃げ出してしまう。行き詰まったアイガは大きな決断をすることになる！一方、バルトは赤刃タイガの工房を訪れ、新ヴァルキリーの開発に動き出す！！

アイガvsハーツのタイトルマッチ！Ｚ４の最後１人であり、ファイの双子の弟ハーツは、デッドハデスと一心同体になる究極の共鳴をするブレーダー。ベイの力を最大に高める代償に、ベイのダメージも自分自身に受けるバトルスタイルを持つ。最重量級ベイ、デッドハデスの痛恨の打撃が、深々とアキレスに打ち込まれる！アイガもより深くアキレスと共鳴するが、ベイの衝撃を感じるようになっていき……

満月の下、アイガとファイ、２人だけの決闘が始まる！ファイの目的は、共鳴で強さを得たアキレスを自分の手で破壊することだった。しかし、黒いオーラを発して立ち向かってくるアイガは、底知れぬパワーをファイに見せつける事になる！？一方、破壊に突き動かされるアイガに、不安をおぼえるバルトは、大きな決断をする！さらに、波乱のベイブレード界では、最後のＺ４の１人がついに動き始める！！

急激に強くなっていたアイガに、驚きながらもバトルを楽しむバルト。しかし、アイガは違った。勝ってこそのバトルだと最強への執念を燃やし、もっともっと強くなることを追い求める。しだいにアイガの様子に変化が……。アキレスと深く共鳴したアイガは、力を暴走させ漆黒のオーラを浮かび上がらせた！危機感を覚え、全力で迎え撃つバルト！タイトルマッチは死闘になっていく！！

世界チャンピオン、蒼井バルトへの挑戦権を得たアイガとファイ。しかしタイトルマッチを前にして、エクステンドプラスドライバーを使いこなせないアイガに、ジャンは師匠であるシャカこと灼炎寺カイザを連れて現れる！アイガに興味を持ったシャカは、バルト戦に向けたシャカ流の特訓を始めるのだった！タイトルマッチ前哨戦、エクスカリバーとシャカが立ちはだかる！！

残り４人となったバトルシップクルーズ。第１試合はファイｖｓジャン、第２試合はアイガｖｓフブキに決定！ゾロから受け取った新たなランチャーとドライバーの性能を引き出せないアイガは、必ず勝つとソーチョー相手に特訓を始める。しかし、その戦い方はまるで相手のベイを破壊するようで、見ていたナルたちを不安にさせる。そんな中、いよいよバトルシップクルーズは最終局面のバトルへと突入する！！

最終目的地であるスペインに到着したベイクイーン号。アイガは早速、バルトの所属チーム・ＢＣソルへ向かうが、森に迷い込んでしまう。そこで出会ったのはフリー・デラホーヤ！世界最強ブレーダーを目の前にして闘争心をむき出しにするアイガはバトルを挑む！しかし、最強無敵を求めて急成長したアイガが危険な何かに目覚めていくのを感じ始めたフリーは、本気を出してアイガを倒しにかかる！！

シーカヤックの競争で意地になり、無人島に迷い込んでしまったアイガ、ジャン、ラバン。自然の猛威とハプニングに襲われるなか、共鳴力を発揮して覚醒したアイガに救われたジャンは、アイガの中にある不思議な力を見抜く。一方、ラバンは対戦相手のファイを占うと、見てはならぬファイの本性を覗いてしまう！衝撃の結末に全てのブレーダー達が戦慄する！！

ソーチョー、フブキ、スオウのベイスターは残り１つ。Ｚ４のジャンが相手に決まったソーチョーは、新必殺技をあみだして打倒エクスカリバーの戦略を練りあげる！一方、フブキの相手はスオウに決定。シュウとの修行であみだした新シュートで攻めに出る！そして、アイガの相手はラバン。レオパルドのハウリングバイトを攻略しないとアイガに勝ち目はない。ベイスターを守るため、負けられないバトルが続いていく！！

３人１組でのバトルロイヤル、３ベイバトルが始まった！残りのベイスターが１つしかないソーチョー、スオウ、ホウイはもう後が無い。しかもスオウとホウイは同じ組、負けた方がバトルクルーズからの脱落が決まってしまう！！一方、追い込まれて弱気になっていくソーチョーを見たアイガは、一緒に闘争心を燃やして特訓を始める！最初の脱落者は誰になってしまうのか！？