全国大会決勝戦から数日後ビルダーズ・コンテスト『メイジン杯』が開催される。そこには、かつて地区予選大会や全国大会で戦ってきたライバルたちも集まっていた。

ついに始まった全国大会決勝戦。トライファイターズはスペースコロニー内部での戦いを選択。二手に分かれてガンプラ学園を迎撃する準備を整える。

ガンプラバトル選手権全国大会決勝戦に進出したのは、トライファイターズと、私立ガンプラ学園のソレスタルスフィアであった。

ユウマとフミナたちの前に天大寺学園のサカイ・ミナトが現れ宣戦をしてくる。一方的にユウマを目の敵にするミナトの行為が解せないフミナはその理由を問う。

全日本ガンプラバトル選手権大会のベスト４メンバーが出そろい、準決勝の対戦相手を決める組み合わせ抽選会が行われる。

全日本ガンプラバトル選手権、準々決勝…。同じ次元覇王流拳法を使うカミキ・セカイとイノセ・ジュンヤの同門対決は熾烈を極めていた。

姉のチナからビルドバーニングの予備パーツを受け取ったユウマは宿舎に戻る途中、不良たちに絡まれてしまう！

シキ・トシヤのガンプラ学園への復讐心で造られたスナイバル・ドラゴ・ギラは、トライファイターズを窮地に追い込んでいた。

トライファイターズ二回戦目の相手は新潟代表、統立学園チームＳＤＲ。ＳＤガンダムを駆使し、緻密な戦術と三兄弟の巧みな連携で大会を勝ち抜いてきた強敵だ。

大会も二回戦目に入り、シード校であるガンプラ学園もバトルに参戦。ガンプラ学園の３人目は、セカイにガンプラ改修を指南していた少女、キジマ・シアであった。