ジュエル学園恒例の駅伝大会がついに開催！　スポーツの大会といえば、さすらいの応援団長ジュエルペット・ダイアナもかけつけて、ちありとルビーといっしょに大会を盛り上げる……はずなのに、何だかダイアナの様子がおかしい。応援されるのが、耐えられない!?

雪が降ったので、ガーネットは世界的なスノーアーティスト・ジュエルペットのユークを呼んで、雪でジュエルペットカフェ２号店を作ることにした。ユークはカフェの建物や家具、食器も全部、雪で作り、さらにアートな雪の像まで作り上げた。雪の像はルビーたちも知らない、ナゾの美少女ジュエルペットで……？

不良をやめて真面目に魔法の宝石をさがそうとしていたタータ。ところが赤い月に目をつけられた。一方、ジュエル学園では、巨大怪獣が襲ってくるというのでジュエル防衛隊を結成して怪獣に立ち向かうことになっていた。

新年を迎えるための大掃除をして、忘年会パーティーを開催！おいしいごちそうとスウィーツに、カラオケに、そして今年の重大ニュースを発表！しかし、ルビーがパーティーを盛り上げようと魔法を使うと、みんなが今年を忘れてしまった!?

クリスマスパーティーの準備に忙しいルビーたち。ルビーたちはパーティーで真田先輩たちのバンドとセッションするのだ。そこに、アメリがひとあしはやくやってきた。アメリはみんなのお手伝いをしようとするが、失敗ばかりしてしまう。

マッサージ店を営んでいたコールだった。しかし、お店は経営に失敗しつぶれてしまった。絶望に打ちひしがれるコールは公園でかわいいお人形を見つけた。やさしい言葉をコールにかけてくれるおしゃべり人形だ。コールはそのお人形に“エンジェルちゃん”と名づけ大切にするが……。

レベルアップして戻ってきたペリドットは占いが的中するようになっていた。ペリドットの占いによればジュエリーナ様の身に大変なことが起きたらしい。お城にかけつけたルビーたちが発見したのは、ジュエリーナさまにそっくりの小さい女の子だった。

勢力を増し、アンハッピネスをまきちらす赤い月に対抗するため、ジュエリーナ様はサフィーに秘密兵器の開発を依頼した。そんなサフィーに恋をしてしまったジュエルペットが……。彼の名はネフライト。さすらいの旅を続けている素朴な男だ。

裏社会のクイーン・ラピスがジュエル学園にやってきた。その目的は、ジュエル学園を乗っ取ること！裏社会のクイーンならではの秘技をくりだすラピスに、ルビーとちありたちは勝てるのか!?そして学園理事長・ジュエリーナ様は？

ガーネットのきりもりにより成り立っていると言えなくもないジュエルペットカフェ・ハッピネス。そんなガーネットのはたらきぶりに目をつけた人物が……。優秀な人材を探すスカウトマンによってガーネットは、ヘッドハンティングならぬペットハンティングされてしまった！