初めての魔法の宝石を手に入れたルビーたち。なにやらステキな魔法がちありにかかり、ジュエル学園はペットカフェの噂で持ちきりに。マジカルにリニューアルしたジュエルペットカフェにもお客さん達がたくさん来るようになった。どうやらお客さんに一番人気なのは新人・ローサ。そんなローサがチヤホヤされる姿を、ラブラは放っておけなかった…。

お城に集められたジュエルペットのルビーたちは、女王・ジュエリーナ様からジュエルボックスを魔法の宝石でいっぱいにするように命じられた。そうすれば何か素敵なことが起きるらしい。魔法の宝石を集めるために、ルビーたちは元気で夢いっぱいの少年少女が集う学校・ジュエル学園に向かった。そこで、ジュエルペットカフェをオープンさせ、みんなと触れ合うことで宝石を集められるらしいのだが……。