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フリーメーカー兄弟はデス・スターの完成とアローヘッドを奪われたことを反乱軍に知らせなければならないが、Ｍ-ＯＣがしつこく追ってくる。そんな中、ローワンたちは反乱軍に連絡を取ると、艦隊はエンドア近くにいて、デス・スターがフル稼働する前に奇襲をかけるという。嫌な予感がするローワンはフォースで感じたことを頼りに兄姉と共に最後の作戦を決行する。

反乱軍やフリーメーカー兄弟との戦いにおける作戦に関して意見が合わないベイダーとＭ-ＯＣ。皇帝は、そんな二人にローワンの捕獲を命じる。一方ローワンはクアリドンで知り合った少女、メイナーからのＳＯＳを受け、ラジャーとともにクアリドンへ向かうが、それは罠だった！ローワンは敵に捕まり、皇帝に差し出されてしまう。ザンダーとコーディは上層部に無断でコルサントに連行されたローワンを助けに向かうが・・・。

ついにカイバー・クリスタルを手に入れたローワンたちは、喜び勇んで帰還する。しかし、ホーム・ワンは帝国軍艦隊の攻撃を受けていて、かなりの劣勢にあった。カイバー・クリスタルは爆発しやすいため、戦闘のさなかに作業するのは危険だった。そこで、フリーメーカー兄弟とクアリーは、アローヘッドを安全な場所へ移すことにする。クアリーはパイロットにヴァレリア中尉を選び、一同は惑星ジャクーへと向かうが、着陸の際・・・。

アローヘッドの完成まで、あとは大きなカイバー・クリスタルを入手するだけとなった。Ｍ-ＯＣに攻撃されながらも、ローワンは何とか集中を保ち、フォースの力でクリスタルのありかを感知する。そしてフリーメーカー兄弟は、その星へと向かう。何とか星にはたどり着けたが、Ｍ-ＯＣの攻撃でフネは損傷していた。さらに、不時着地点の近くにクリスタルは多数あったが、どれもアローヘッドの動力源にするにはサイズが不足していた。

コーディは帝国軍の技術者に扮して、スター・デストロイヤーに潜入。カイバー・クリスタル捜索候補地のリストを入手し、痕跡隠しに偽データを残して戻る。だが、ラジャーは誤って、偽データではなく料理のレシピを渡していた。Ｍ-ＯＣはそのレシピに気付き、そこからフリーメーカー兄弟を追跡する。リストにあった星、クアリドンに降り立ったローワンたちは、先祖代々引き継いだクリスタルのペンダントを持っている一族と出会う。

アローヘッド製造に必要なパーツはあとわずか。その１つ、エネルギー・マトリックス活性体が、昔のフリーメーカーの店にあることをザンダーは思い出す。そこで、フリーメーカー兄弟は逃亡以来久しぶりに、宇宙ステーション「ウィール」に戻ってきた。すると彼らの店だった場所は今、ウィック・クーパーのカフェになっていた。お目当てのパーツは、なんとコーヒー・マシンに使われている。３人は閉店後に忍び込もうとするが・・・。

スター・デストロイヤーにスパイとして潜入していた反乱軍のダーリン少佐が情報を入手し、ポッドで脱出する。その行き先が廃品置き場ということで、アクバー提督に任じられ、フリーメーカー兄弟が回収に。ローワンは、アローヘッドに必要なパーツが、かつて悪党や海賊が好んだコレリアン・ディフェンダーにしかついてないと聞いて、タコダナのマズを思い出す。彼女に聞けば何か分かると思い、タコダナに寄り道してもらうが・・・。

アローヘッド製造に必要な希少な金属エンバースチール。これが翼に使われているスター・シャトルが、オークションに出品されることが分かる。コーディは落札用の大金をアクバー提督から預かり、兄弟とオークションへ。オークションは帝国主催のため、コーディは姿形を変えられるクローダイトの姫に扮して、今日は違う顔をつけてきたと言い張り、会場入りに成功。だが高貴な人は競りに参加できず、コーディはその役目を兄弟に託す。

ローワンは、夢で見たアローヘッドがどんなフネなのかクアリーに説明しようとするが、今ひとつイメージがはっきりしない。するとクアリーが、かつて賢人たちがインスピレーションを求めて訪れたという惑星、アリスタン・ノアの名を出す。ローワンはさっそく行こうとするが、コーディもザンダーも忙しい。そこで、ローワンとクアリー、ラジャーの３人だけで、その星へ向かう。アリスタン・ノアの街は今や廃墟となっていたが・・・。

反乱同盟軍アクバー提督の旗艦ホーム・ワンで新生活を始めたフリーメーカー兄弟。ザンダーとコーディはメカニックとして頑張っていたが、ローワンは自分だけ役立たずだと落ち込む。すると、ヘラ・シンドゥーラ将軍が、ローワンをクアリーの作業場へ行かせる。クアリーはかつてＢウイングの試作機を開発したエンジニアで、今は新型のフネの開発にいそしんでいた。そして、３兄弟のティボルトへの部品の回収に、クアリーも同行する。