【きょうは妖怪ホリデー！】
ハナホ人と壮絶な戦いを繰り広げるケータ。友だち妖怪を召喚しようとするが、妖怪ウォッチからはいつもの召喚音が流れてこない。なんと今日は、妖怪労働組合に所属している妖怪たちが絶対に働いてはいけない日『妖怪ホリデー』だった！どのメダルを使っても妖怪たちを召喚できないケータが呼び出したのは、あの“お祓いのお爺さん”！ところが、ハナホ人の強力な力で、お爺さんの鼻の穴にとんでもない物が入ろうとしている！

【こわいライトゾーン　～白い恐怖～】
虫歯ができてしまい、歯医者さんへと向かうケータ。まわりに妖怪の姿も見当たらず、妖怪のしわざではないらしい。そして、緊張が続くケータの心は、なんでもかんでも恐怖に感じる“こわいライトゾーン”へと入ってしまった！受付のお姉さんの顔は恐ろしく歪み、治療室からは壮絶な叫び声が聞こえてくる・・・！ところが、なんとか治療を終えたケータに驚きの事実が伝えられる。ウィスパー、もう遅いよ！

【新人のざしきわらし　恋愛編】

【妖怪うらや飯】
家族そろってファミレスへとやってきたケータたち。ところが、自分の料理が運ばれてきたというのに、ケータの父と母は他人の料理をうらやましがっている！２人には、人の食べているものが美味しそうに見える妖怪“うらや飯”が取り憑いていた！ところがそこに“つまみぐいのすけ”もやってきて、人の料理をどんどんつまみ食いしている。こんな時には、いつもお腹を空かしている“あの妖怪”を召喚だ！

【ヒキコウモリのヒミツ】
ケータの部屋は、ウィスパーが妖魔界最大のネット通販サイト「妖ＺＯＮ」から買い物したグッズでいっぱい。今日も荷物が届いたウィスパーに、ケータとジバニャンの視線は冷やか。働いていないヒキコウモリとは違うんですよ！と逆ギレのウィスパーだが、なんと知らない間にヒキコウモリは大金持ちになっていた！今日もクローゼットに引きこもるヒキコウモリだが、その中はとんでもないことになっていて・・・。

【新人のざしきわらし 受験編】

【妖怪えこひい鬼】
遅刻をしても怒られないし、先生がフミちゃんだけにはとっても優しい。なんとフミちゃんには、取り憑いた人をひいきさせる妖怪“えこひい鬼”が！そんなえこひい鬼が、今度はケータに取り憑いた！何だか、えこひいきっていいかも。と思っているケータに、クラス中の冷めた視線が！やっぱりこれはマズイよ！えこひい鬼を倒すためにケータが召喚した妖怪は、男気あふれるあの妖怪だ！！

【妖怪しわくちゃん】
ケータが学校から帰ってくると、ランドセルに入れていたプリントがしわくちゃになっていた。ちゃんと教科書とノートの間に挟んでおいたのに・・・。これってもしかして！そこには、何でもしわくちゃにしてしまう妖怪“しわくちゃん”がいた！このままだと家中しわくちゃにされちゃうよ！そこへ颯爽とあらわれたのは、花子さん！しわくちゃんを元の姿に戻すため、花子さんによる美容と健康のプロデュースがはじまった！！

【新人のざしきわらし】

【妖怪魔ガサス】
教科書に落書きをして先生に怒られるケータ。どうしてこんなことしたんだろ？と思っていると、今度はフミちゃんがとんでもないイタズラをしようとしている！そこには、やってはいけないことを、ついついやってしまう妖怪“魔ガサス”がいた！その後も魔ガサスの勢いはとまらない！家に帰ってきたケータは、洗濯カゴの中の臭そうなお父さんの靴下を見ると、ついつい・・・。ってそれは、危険すぎるよ！！

【にせケータあらわる！】
ロボニャンに弟子入りしたモノマネキンが、ケータの姿であらわれた！人の姿をモノマネできるようになったモノマネキンが、ケータの姿で登校してみんなを騙すことができれば最終テストに合格だ！ところが、モノマネキンは本物のケータと違ってテンションが超高い！これってちょっと無理があるよ！？と思っていると、クラスのみんながモノマネキンに注目している！あれ！？本物より人気者になってない！？

【どんな時も命がけのざしきわらし】

【ご主人様はフミちゃん】
ケータのだらしない生活を見ながら「もっとキレイ好きで優しいご主人だったら良かったのに」とつぶやくウィスパー。目が覚めると、ウィスパーはフミちゃんの家に！「これはひょっとして、パラレルワールドというものに迷い込んでしまったのでしょうか・・・」と困惑していると、フミちゃんのお母さんがムリカベに憑りつかれて大ピンチ！するとフミちゃんは、ムリカベを倒そうとウィスパーにあるお願いをしてきて…

【ミリタリーなざしきわらし】

【神経質なざしきわらし】
ケータの家に神経質なざしきわらしがやってきた。乱暴に脱ぎ捨てたケータの靴をきちんと揃え、おやつの食べカスを拾ってくれる。ところが、そんな健気なざしきわらしでもついにキレてしまう出来事が…！！

【妖怪わらぇ姉】
お楽しみ会で“お笑い”をやることになったケータだったが、リハーサルでは全然ウケない！ケータには、人の笑いを吸って、一人で笑い続ける妖怪“わらぇ姉”が取り憑いていた！そんな、わらぇ姉に笑いの特訓を受けたケータは・・・。

【犬時間】
明日にテストを控えるケータが、「オレも小学生なんかやめて、犬になりたいよー」と言っていると、本当に犬になってしまった！慌てるケータのもとにやってきたのは、コマさんたち犬の妖怪！ケータは人間に戻ることが出来るのか！？

【伝説の牛乳ぞうきん】
給食の時間、床にこぼれた牛乳を拭きとったフミちゃんは、乾かすために“ぞうきん”を窓際にかける。ところが、これが悪夢の始まりであった…。「おえぇぇぇーーーーー！」ぞうきんが放つ悪臭が、クラス中に充満した！あまりの悪臭に妖怪の仕業ではないかと疑うケータ。そこには、世の中の臭いものを司る妖怪“へこ鬼神”がいた！へこ鬼神を倒すために、次々と友だち妖怪を召喚するが、だれも牛乳ぞうきんの臭いに耐えられない！そして、ついにケータたちは最強の牛乳ぞうきんを目にする！！

【金妖スペシャル！コマさん探検隊 最終回 来るか来るかとは思っていたが！やっぱり訪れた衝撃の結末！『矢良瀬ディレクター』最後の日！】

【妖怪アニ鬼】
ケータのクラスに転校生がやってきた。困っている人を見つけると、不器用ながらも手助けをする男気あふれる硬派な転校生だ！そんな転校生をみんなが「アニキ」と呼んで、一生懸命慕うようになってしまった。でもこれって、何かおかしくない！？ケータが妖怪ウォッチで照らすと、そこには取り憑いた人間を男気あふれる人間にしてしまう妖怪“アニ鬼”がいた！

【妖怪ばか頭巾】
「真面目に掃除してよね！」フミちゃんの冷たい目線も気にせず、クマやカンチ、そしてケータたち男子が掃除の時間に掃除道具で遊んでいる。そんな男子たちには、くだらないことをさせて盛り上げる妖怪“ばか頭巾”が取り憑いていた！ところが、男子にこんなことをさせる“ばか頭巾”には、“わすれん帽”と同じような悲しい過去があった。そんな“ばか頭巾”と“わすれん帽”が、突然コンビを組んで…！？

【金妖スペシャル！コマさん探検隊！猛威のブリザード！ヒマラヤ完全踏破の果てに、伝説の雪男『イエ～イティ』を見た！】

【妖怪エイプリルフール】
妖怪の世界にはないと思っていたエイプリルフール。ところが、ケータたちの前にセバスチャンがあらわれ、今年から『地獄の妖怪エイプリルフール』を始めるという。ウソをつき通せなかった妖怪は、なんとフィギュアにされて売り飛ばされてしまう！次々と妖怪たちがウソをつく中、ついにジバニャンとウィスパーの順番がやってきた…。恐怖に震える彼らは、ウソをつき通せるのか！？

【妖怪なまはげ】
「悪い子はいねが～」と子供たちを驚かす妖怪“なまはげ”が、警察に捕まってしまった！ケータたちは“なまはげ”のイメチェンを考えてあげるが、今度は子供たちが全然驚かない…。そこで、イメチェンに詳しい花子さんに手伝ってもらったら大成功！日本中が“NAMAHAGE”に注目するようになった。ところが、“NAMAHAGE”ブームで大儲けした花子さんには、予想外の事態が待ち受けていた！！

【金妖スペシャル！コマさん探検隊！史上最大の歴史ミステリー！行く手を阻む謎の集団！徹底捜索！『幕府埋蔵金』がいま、その全貌を現す！】

【戦え！妖怪ウォッチバスターズ！】
アッカンベーカリーに限定メロンパンを買いにいこうと思ったケータだったが、お母さんから留守番を頼まれてしまった。ダッシュで買いにいって戻ってくればいいか！ところが、外に出たとたん…やっぱり鬼時間になってしまった！赤鬼がどんどん迫ってくるケータたちの前にあらわれたのは、ブリー隊長とナメクジ軍曹！役割を決めて戦えというブリー隊長だが、誰もタンクの役をやりたがらない！

【妖怪よつめ】
ショッピングモールで開催されている占い師のイベントに、フミちゃんが参加しているのを発見するケータ。すると、占い師がフミちゃんの名前を言い当て、運命の人をカメラに写しだした！それもそのはず、占い師には妖怪“よつめ”が取り憑いていたのだ！自分の運命の相手が気になるケータは、見て欲しいと“よつめ”に迫る。ところが、カメラに映しだされたのは…！！

【金妖スペシャル！コマさん探検隊！緑の魔境・アマゾンの奥地へ！伝説の半魚人『ギョッピアーラ』を追え！】