九十九遊馬が優勝を手にしたWDC（ワールド・デュエル・カーニバル）が幕を閉じ、平和が訪れたハートランド・シティ。
遊馬とアストラルも、仲間たちとともに学園生活に戻り、デュエルを楽しんでいた。
一方その陰で、アストラルの記憶のかけらであるNo.（ナンバーズ）を狙い、暗躍している者たちがいた。それはアストラル世界と敵対するバリアン世界。
彼らはモンスター・エクシーズをカオス化する「RUM（ランクアップマジック）」を切り札に、遊馬たちの前に立ちはだかる！
遊馬とアストラルは、想像をはるかに上回るバリアンのデュエルに驚愕する…。
しかしこの危機に、「アストラル世界を救いたい！」という遊馬の強い想いに動かされたカイトと凌牙が再び集結。
3人は仲間との絆を胸に、エースモンスターを従えデュエルに挑む！
遊馬とアストラルの新たなる闘いが、今始まる!!
遊馬とアストラルも、仲間たちとともに学園生活に戻り、デュエルを楽しんでいた。
一方その陰で、アストラルの記憶のかけらであるNo.（ナンバーズ）を狙い、暗躍している者たちがいた。それはアストラル世界と敵対するバリアン世界。
彼らはモンスター・エクシーズをカオス化する「RUM（ランクアップマジック）」を切り札に、遊馬たちの前に立ちはだかる！
遊馬とアストラルは、想像をはるかに上回るバリアンのデュエルに驚愕する…。
しかしこの危機に、「アストラル世界を救いたい！」という遊馬の強い想いに動かされたカイトと凌牙が再び集結。
3人は仲間との絆を胸に、エースモンスターを従えデュエルに挑む！
遊馬とアストラルの新たなる闘いが、今始まる!!