伝説のクリーチャーを求めて、過去へ出発？！
デュエマ４０００年の歴史を解き放ち、１２枚のカードを探せ！！

『さぁジョーよ、お前も今こそ進化の時！
解き放つのだ。デュエマ４０００年の歴史を！』

ジョーとデッキーは、ある日夢の中で不思議なお告げを聞く。

切札家で見つけた謎の巻物がきっかけとなり、ジョーはキラ、ボルツ、キャップ、ももをはじめとする仲間と共に伝説の１２枚のカードを探しに行くことに。
その行き先は・・・過去の世界？！

さらなる力を求め、デュエマ４０００年の歴史を解き放て！