熱き激闘の果てにD4の座を退いたボウイ。転がり込んだデュエマさいこークラブで自堕落に過ごしながら、これまでとの待遇の差を思い知る日々を送っていた。一方、新たなメンバーを迎えたD4では早速大波乱の予感……！？特別ルールのデュエマによる、カイザの洗礼が幕を開ける！

デュエマさいこークラブ解散のため奮闘したものの、使命を果たすことができなかったボウイ。ふがいない結果を見たカイザは、ボウイにある試練を課すことに。その内容は新たなD4候補とのデュエマ！対戦相手に名乗りを挙げたのはまさかの人物で──！？D4の座をかけた負けられない戦いが始まる！

学園トップのD4という立場でありながらデュエマさいこークラブをかばってしまったボウイ。そのことをきっかけにファルゴから目を付けられ、ウィンたちのクラブを潰すことを約束させられてしまう。ウィンたちが今後も学園でデュエマを続けるため、悩みながらもデュエマさいこークラブに近づくボウイだったが……。

ついにファルゴへ宣戦布告したデュエマさいこークラブは部室で迎え撃つ準備をしていた。一方、クラブの一員として過ごすカレンは自分の生い立ちと使命、そして周りの友達とのギャップに思い悩んでいた。そんなカレンにウィンたちがかけた言葉とは？そして、カレンが出した答えとは──！？

デュエマさいこークラブの部室が何者かの手による嫌がらせの被害に！その魔の手は顧問のエリザ先生にも迫っていた。ウィンたちは犯人を見つけ出すために立ち上がるが、最も怪しいと思われるファルゴにはアリバイが。一方、ひとり犯人を追うウガタはとある人物を怪しいとにらんでいて……。

マイハマ学園の特殊学習施設「心の館」。ウィンたちはそこで伝説のデュエリストと呼ばれる先生からデュエマに必要な「心」を鍛える特別授業を受けることに。楽しみにするウィンだったが、突如現れたファルゴも授業に参加することになり……。デュエマさいこークラブを目の敵にするファルゴの企みとは一体何なのか！？

斬札ウィン、新たな物語の始まりを振り返り！ウィンが入学したのはデュエマの学校「マイハマ学園」！毎日デュエマで遊べる夢のような生活！──と思いきや、そこで待っていたのは……！？

デュエマさいこークラブのみんなは今日も楽しく活動中！しかしウィンたちを目の敵にするD4のファルゴの策略により、マズキとケンドラがあらぬ疑いをかけられクラブは存続の危機に陥ってしまう……。そこで立ち上がったのはまさかのケンドラ──！？ファルゴからクラブを守るため、無謀にも思える勝負を挑む！

無事設立条件を満たして発足した「デュエマさいこークラブ」。ウガタは謎多きウィンの秘密を探るために観察を開始する。一方、ウィンはここ最近のウィンナー不足でカラカラになった邪神くんのためにウィンナーを振る舞うことに。それを食べた邪神くんの体には力がみなぎり始めて……！？

マイハマ学園での部活動設立には学園に君臨するデュエマ四天王「D4」のリーダー、プリンス・カイザの承認が必要だと知ったウィン。生徒会でもあるD4のもとへ向かい無謀にもカイザを勧誘するが、冷たくあしらわれてしまう。そこでウィンはクラブの承認とカイザの入部をかけてカイザにデュエマを挑む！