ファンディーさんの最後の指令をクリアし再びファントミラージュへと変身することができたココミ達。しかし、早くもココミ達４人はファントミラージュ卒業を告げられてしまう。大きな成長を遂げた４人の涙の卒業式が今始まろうとしている…。

ココミ達4人はファンディーさんからの最後の指令の答えを探していた。そんな時、文秋はファントミ復活の署名活動を行っていたのだ。そんな文秋君のおかげで自分達の答えを見つけだしたココミ達。その答えとは一体…。

サカサーマのイケない心、ちょーだいしたファントミラージュ。そして、これまでの活動を振り返るココミ達だったがファンディーさんから最後の指令を言い渡される。ココミ達の任務はまだまだ終わらない！？

ついに、ファントミラージュはサカサーマとの直接対決。サカサーマ様はＡＱイケナイヤー慎一の作り出した「パワーアップルパイ」によりパワーアップし大ピンチ！どうなる、ファントミラージュ…！

ＡＱイケナイヤーになってしまったココミのパパ・慎一。そんな一大事も知らずココミたちはアベコベ刑事と対決。ファントミラージュは逆逆警察と最後の決戦となるのか・・・！？

夢を取り戻したマギャク巡査をみて、再び自分の夢を追いかけることにしたギャンヌ署長。だが、ギャンヌ署長はサカサーマによってイケナイヤーにされてしまう！現場に居たセイラは、ギャンヌ署長のイケない心、ちょーだいできるのか！？

ファントミラージュとアミーゴは『モドサナキャラメル』を取り返す為、逆逆警察のアジトに潜入成功。
しかし、マギャク巡査に潜入がバレてしまった。ついに、逆逆警察と直接対決が始まろうとしている！

なんと謎の女性の正体は元ファントミラージュ！？そんな謎の女性から『モドサナキャラメル』の存在を教えてもらい映画館にやってきたが、ポップコーン売りのメルちゃんがイケナイヤーに！
ファントミラージュはメルちゃんを助け出し、『モドサナキャラメル』をゲットできるのか！？

ポップコーンから元に戻れないサキ。方法を考えるココミたちは、逆逆警察に詳しいサライの特別授業を受ける事に！そこへスイーツカフェを見ている謎の女性が…。

正体がバレてしまいポップコーンになったサキ。ココミたちはサキをポップコーンから戻すため、「モドソルト」を探しに出る。そんな中、公園にイケナイヤーが現れ大パニック！ファントミラージュはイケナイヤーを助け出し「モドソルト」を見つけ出すことはできるのか！？