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伝説の鍛冶職人「ゴエモン」にグレート飛空艇を作製してもらえるようになったチャップたち。ただし、制作するためには、いくつかのブランドの技術を結集させなければならない。最初に向かったブランドは、もともと造船業を生業にしていたブランド「デトン」。デトンの造船技術があれば、魔障壁を越えるための衝撃に耐えられる船体を作ることができるらしい。チャップたちはデトン本社にいる技術責任者ライスの元を尋ね、グレート飛空艇の設計図の作成を依頼するも、ライスは急に船の設計イメージが浮かばないスランプに陥っていた。船のデザインが思いつくような女性の美しい身体のラインを目にすることが出来ればもしかしたらスランプから脱することができるかもしれないと言うライスだが、果たして、その女性とは…？

復活してしまった魔王竜スカードンを討伐するため、スカードンが向かったデミグラスキャッスルへ向かうことになったチャップ達。しかし、デミグラスキャッスルは魔障壁を超えた先にあるため、ビネーマンショックの影響で交通機関はストップしたままの状況ではたどり着くことができない。困ったチャップたちはカルボナーラの元へ訪れると、魔障壁を越える機能がついている「グレート飛空艇」の設計図を渡される。グレート飛空艇を作るためにはかつて飛空艇の作製指揮をとった「伝説の職人」と呼ばれた人物の力が不可欠らしい。しかし、今その職人がどこにいるのかわからず、デアファルコンの力を借りて探し出すことになるのだが…？

ビネガーを倒したチャップ達は意気揚々とフレンチトースターに帰還する。しかし、ビネガーがいなくなったことで流通機能がダウンしてしまったらしく、世界は「ビネーマンショック」に陥ってしまっていた。お店に商品が並ばなくなってしまい、困り果てたカルボナーラを見て、チャップ達は自分達がビネガーを倒したことが間違いだったのかと感じ始めるも、王様の手腕によってその混乱も収束へ向かう。
かくして、ビネガーを倒すために冒険をしてきたチャップたちは、それぞれの生活に戻ることに。世界に平和が訪れた…かのように思えたが、ヴィンサントだけが、世界に起ころうとしている新たな危機を感じ取っているようで…？

ダークドラゴンナイトとなったビネガーによって操られてしまったヴィンサントは、ドラゴンとなってチャップに牙を向ける。応戦するチャップはスナックで仲間を呼び出したりドラゴンナイトの奥義を繰り出したりして、なんとか元の姿へ戻すことに成功する。しかし、操られたままだったヴィンサントは再びチャップに襲い掛かり、強力な一撃を繰り出す。倒されてしまったチャップは、生死を彷徨い、精神世界でメローラやチャップのばあちゃんと対面し、問われるのであった。ビネガーを倒すためだけに生きてきたのか、本当にビネガーに「勝てる」と信じているのか？チャップが見出した答えとは、そしてビネガーとの決戦の行方は…!?

ビネガーとの決戦に向けてドラゴン少林寺に戻ってきたチャップ達。デアファルコンからは餞別としてドラゴンナイトでないと装着できない剣「スカイホーク」と、盾「タートルシェル」を託される。ビネガーパレスへの突入方法を考えるチャップたちだが、配下のドラゴンや迎撃システムが待ち構える鉄壁の守りの中、考えられる作戦は「正面突破」のただひとつ…!?激戦の末、なんとかビネガーの元へたどり着くも、デアファルコンからも聞かされていたビネガーの「ダークドラゴンナイト」の力に圧倒されるチャップたち。ビネガーによって操られたペペロンが仲間に斧を振りかざそうとするとき、チャップにある異変が起きる‼

ついにビネガーパレスへ向かう日がやってくる。命をかけて戦わねばならないチャップ達は、思い残すことがないように、家族に会ったり、大切な人に別れを告げたり、それぞれやるべきことを済ませるために一度フレンチトースターへ帰還する。解散してすぐにメローラの元へ向かったチャップであったが、そこにメローラの姿はなく落胆する。すると、ブタ子があと少しで飛行免許を取得できると聞き、試験に付き合うことに。マヨネ、ペペロン、ゴブさん、ヴィンサントもそれぞれの時間を過ごす。会うのはこれが最後になると覚悟を決めるが、周りの人たちから発せられるメッセージは思いもよらないものだった。

ドラゴンナイトになるための修行として、強い相手と戦ってきたチャップ達。最後の相手は、なんとデアファルコン！！勝負の内容は･･･命がけでデアファルコンと戦うこと。今までの修行の集大成として、これまで集めたジャラやスナック、あらゆるものを駆使して挑めと言われる。ドラゴン少林寺に戻ってきたチャップ達は、戦いに備えて作戦を練る。ドラゴン和尚にデアファルコンの弱点が無いか聞いてみるも、あえなく突っぱねられてしまう。チャップたちは自分たちが持っているものを出し合い、戦いに使えそうなものがないか知恵を絞り出す。果たして、竜の力を宿す魔人デアファルコンに勝つことはできるのだろうか…!?

修行のため強い者たちと戦うチャップとヴィンサントだったが、ドラゴンナイトになるための道のりはまだ遠い。デアファルコンは、目には見えないものを心で見る力「心の目」が足りないと指摘する。さらに、究極の心眼・ドラゴンチャクラはドラゴンナイトだけが開くと言われており、心の目を鍛えるために「最強の強い奴」に挑むことに。その相手とは、なんと森の占い師・白雪姫だった！彼女は眠りながらあらゆることをするあまり、心の目を会得したらしい。そんな白雪姫と目隠しドッジボールで対決するも、チャップたちはコテンパンにやられてしまう。心の目を開くにはどうしたらいいか白雪姫に占ってもらうと、フレンチトースターにいる3体のモンスターが導いてくれるらしい…!?

ドラゴンナイトになるために強い者と戦う修行、次なる戦いは、元赤ずきん４８センターだったアカミとのダンス対決！早速アカミに会いに行くと、かつてのようなおどおどした様子はまるでなく、人気者になって態度も物言いも天狗になっていた。ギャラを要求するなど高飛車な態度を取られるが、なんとか対決を承諾してもらう。ダンス対決の判定方法については、ネットで配信し視聴者に決めてもらうことに。はたしてその結果は…!?そしてアカミの次の相手は、チャップがお世話になっていたヤマジェニ・インの女主人ジェニファー山本だった！　チャーハン作りで対決をすることになるが、料理経験のあるヴィンサントと違って、チャップは料理をしたことがほとんど無く…。

魔人デアファルコンによる、ドラゴンナイトになるための修行が始まった！ 強くなるためには「強い者」と戦う必要があるという。最初に戦う相手は、フレンチトースターにいると聞き、デアファルコンのドラゴンワープでチャップたちは久しぶりにフレンチトースターへ帰還する。そこで強い者だと紹介されたのは、武器屋のカルボナーラだった！　彼はベイゴマのグランドチャンピオンでその実力は本物、チャップたちはあっさりと負けてしまう。修行をクリアするためにも引き下がることができないチャップたちは再戦を頼み込み、翌日開かれるベイゴマ世界大会で再び挑むことになる。カルボナーラからは、「紐と風を制するものは、ベイゴマを制す」というアドバイスをもらうが…!?