トレインベース・ジオフロントで進行するエネルギー採掘工事。
そこに眠るダイヤモンド話に夢中になっていたトレインヒーロー達。
そんな時、アンへジオフロントより救助要請が届く。
サムの誘導を受けながら現場に急行するアンであったが、突然、サムとアンのリンクが切れてしまった。心配するトレイン達の間にアンの悲鳴が鳴り響いた。アール、ゴウ、サムは現場に急行したのだが、そこで待ち構えていたものは・・・？

大雨にみまわれたブルー半島国定公園。その雨の影響を受け土砂崩れが発生し、電車が洞窟内に閉じ込められてしまった。車内には、バカンスに向かう途中のラディア王女と執事の姿があった。ニール教官は、リヨン川の任務を終え現場の近くにいたアール・ゴウ・サムに出動を要請する。すぐに現場に駆けつけるがメンテナンス不足が災いしアールの足は異常をきたす。果たして救助はうまくいくのか、乗客は救えるのか！

大雨にみまわれたリヨン川、大量の水がこの川にかかる大きな鉄橋に襲いかかり線路を水の中に沈めようとしていた。その時、この鉄橋に差し掛かる一台の列車の姿が！地球救助隊の機転で間一髪大惨事を免れたようにみえたが事件は起きた！トレインヒーロー達がすぐに駆けつけたが、一部橋脚は崩れレールを支えるものがなかった。そこでサムはアールとゴウのスピードを生かした大胆な作戦を思いつく！
果たして作戦はうまくいくのか・・・。

トレーニング中のトレインヒーロー達にキャプテン・アクネからのＳＯＳが入る。
ノースランドで発生した森林大火災により乗客を乗せた列車が立ち往生してしまったのだ。
すぐに救助に向かうトレインヒーロー達だが、燃え広がる炎にアールとゴウは、まったく太刀打ちができなかった。得意のサーチ機能も発揮できず落ち込むサムであったが、ある閃きが走る！
果たして乗客を救うことができるのか、森林火災は止めることができるのか・・・。

スカイステーションでの救助活動の後、トレインヒーロー達はトレーニングに励む毎日を送っていたが、アールにはひとつの疑問があった。「何故ニール教官は教官になったのか…」。この疑問を解き明かすためにトレインヒーロー達は、先端技術チームリーダーのドクター・マックに質問を投げかける。彼の話は10年前に起きた、ある大きな事故の話に及ぶ、マックは、この事故を引き起こしたラディア王女を救出に向かったニールの雄姿を語った。

2100年、開発が始まった「レーザーレール」を走るためにトレインベースに招集されたトレインヒーロー達。ここへ来て１ヵ月で緊急出動命令が下る。開設記念行事にわくスカイステーションで大きな事故が発生してしまったのだ。現場にかけつけるトレインヒーロー達であったが、初めての救助活動故にミスを繰り返す。そしてそんな時、小さな子供がスカイステーションから落下するという大事故が発生。果たして彼らは救助することができるのか…。