強力な"電獣"ヴォルトグが出現！　必死のテオの攻防で怪獣を退けるが、それはUTTFが仕組んだ実験だった。
そんな中、イブキは部室で倫太郎の退学届を拾ってしまう！？　しかも、モルモットのお世話当番で二人は一緒になるのだった……。
再び現れたヴォルトグが進撃する中で、イブキと倫太郎がエレベーターに閉じ込められてしまう！

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無数に広がるパラレルワールド、その一つで奇跡が起きようとしている……。
古びたアパートで冴えない日々を送るエーコの元に、突然赤い球が姿を現す！　エーコからの問いに、赤い球は「答え」に導こうとして……なんと「テオ」の物語を上映し始めた！？
はたしてエーコと赤い球は、「答え」を出すことが出来るのか？

なんとか難を逃れた天文研究会メンバー、しかしエマの様子が何だかおかしい……？
一方、イブキと苫米地は鳥怪獣バルミリオスの出生にまつわる手がかりを偶然見つけ、その出所を探り始めるのだが、その先には信じられない事実が！
バルミリオスによる被害を食い止めるため、ベッチが奔走する！！

イブキたちは、宇宙ポッドの一件で遭遇した今日子がUTTFの人間だと知り動揺する。
UTTFから守るため、プッチーの引っ越しを宣言するエマ。
その一方、苫米地が猫のお世話で多忙であることを知ったイブキは手伝いを申し出る。そんなとき、鳥怪獣が現れ、苫米地と猫たちに魔の手が迫る！

宇宙ポッドを調べるカンナ。イブキとエマも加わり、ポッドの仕組みを解明していく。
その裏で、カンナの大切なキーホルダーがなくなってしまった！
UTTF調査員の今日子と美濃部教授が宇宙ポッドの存在に迫る中、再びドシハガチが出現する！
はたしてイブキはドシハガチを止められるのか！？ そしてカンナのキーホルダーの行方は！？

プチ怪獣ことプッチーのお世話を天文研究会でしようと言うエマ。
しかしイブキは、プッチーと出会った山にあった宇宙ポッドで故郷の星に帰すことを提案する。
一方、その山では美濃部によるワークショップが予定されており、プッチーの存在が人々に気付かれるかもしれない！
ワークショップに参加するイブキ、そこには同じ天文研究会のカンナの姿もあった。

2体の怪獣に翻弄されたテオは、力を使い果たしてしまう…。
そして、怪獣が進撃する先は明心大学！？
混乱が広がるさなか、プチ怪獣が行方不明に！
イブキたち天文研究会メンバー、美濃部と今日子、さらには怪獣も巻き込みそれぞれの目的が絡み合う中、プチ怪獣に絶体絶命の危機が迫る！

プチ怪獣と出会ったイブキは、匿う場所を求めて大学を奔走していく。
一方、謎の組織UTTFの調査員、志賀今日子が怪獣の脅威に対して動き始め、明心大学の美濃部教授に接触。
ようやく見つけたプチ怪獣の隠し場所で一安心したのも束の間、天文研究会に入会することになったイブキの歓迎会が始まってしまう！？

明心大学獣医学部に通う光石イブキは、実は宇宙人。
故郷の星を失い、独りで地球にやってきた。
地球の文化に触れながら穏やかな毎日を過ごしていたが、ある日隕石の落下により慌ただしくなる人々の雑踏の中で、イブキの世界がまたしても一変する！