第13話「意外なる挑戦者たち！？　命がけのデュエマ大運動会！」

ジョーの家に届いた、一通の果たし状。そこには「学校に来い」とだけ書かれていた。アバクとの再戦に奮い立つジョーだったが、そこにはウサギ団をはじめとしたジョーのかつての敵たちが集まっていた！「脇役軍団」を自称する彼らから提案されたのは、「デュエマ大運動会」だった・・・！

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第12話「大自然のバイブス！　生まれ変わりし、ジョラゴン！」

自然文明の女王を説得し、ジョラゴンを復活させることに成功したジョー。久々の再会に心を躍らせるが、ジョラゴンの様子がおかしい。常にハイテンションかつ、突然生配信を始めるなど、以前のジョラゴンとは全く別の性格となってしまっていた。果たして、打倒ジャオウガの助けとなるのか？！

第11話「ドラゴンと鬼の災厄！？　封印されしジョラゴンを解き放て！」

ジャオウガを倒すために、さらに強くなるにはジョラゴンの力が必要だと考えたジョー。現在のジョラゴンの居場所は、自然文明の姫・ももが知っていた。早速ももに連れられ、ジョーは自然文明の女王様に会いにいくことになるが、簡単にジョラゴンに会えないとある事情があった。

第10話「王来学園の決闘！　切札ジョーｖｓ鬼札アバク！」

王来学園復活のために、勝太の魂を利用したアバク。勝太の意識を元に戻すために、アバクへ挑むジョー。しかし、鬼軍団に次々と攻められて大ピンチ！ジョニーで応戦し形勢逆転を狙うが、ついに鬼の頂点・ジャオウガが現れた・・・

第9話「魂を取り戻せ！　ジャオウガ復活を阻止せよ！」

王来学園復活のためには、ジャオウガの復活が必要だと槍は語る。同じ頃、ジョー達はジャオウガの復活を止めるために、巨大エネルギーの反応があった学園の地下へ向かっていた。ジョーがアジトまでたどり着くことを危惧するハイドだが、アバクは余裕の表情で・・・

第8話「ドラゴンと鬼の死闘！　切札勝太ｖｓ天王寺ハイド！」

ジョーの父・勝太の前に、アバクの仲間である天王子ハイドが現れた。ハイドの目的は、デッキーの力を引き出すための鍵を手に入れることだった。一方で半ば強引にデッキーの力を奪おうとする槍をみて、アバク側についたヒミコ、ウサギ団すらその姿に戸惑いと恐怖を隠せずにいた。

第7話「父・勝太の帰宅！　切札家、水入らずの日ジョー！」

デッキーの行方がつかめず、落ち込むジョーの前に突如飛行物体が現れる。そこに乗っていたのは、ジョーの父・勝太だった！宇宙でかつての相棒とともにクリーチャーの調査などをしている勝太。滅多に家に帰ることのない勝太がやってきたことには、何か意味があるようで・・・

第6話「６年生のビッグイベント！　恐怖と友ジョーの林間学校！」

小学校最後の林間学校へやってきたジョー達。思い出作りに期待を高めるが、到着するや否や山の地主による「究極のレクリエーション」が始まった。怪しいゲームへの参加を躊躇うが、珍しい報酬を手に入れられると分かると目の色を変える児童達。恐ろしいゲームが始まることを、彼らはまだ知らなかった・・・

特別編「振り返りスペシャル！ジョーVSデッキー、本気のデュエマ！！」

ジョーVSデッキーがデュエマをした第1話を振り返り！ジョー編最終章、始まりのストーリーをもう一度お楽しみください！！

第5話「リッチになってカムバック！　ウサギ団の大豪邸に潜入せよ！」

デッキーを取り戻そうと、アバク達の居場所を探す中で「デュエマが強い男の子２人、女の子１人の３人組」の噂を耳にする。手がかりをもとにジョー達がたどり着いたのは、とんでもない豪邸だった！ここの持ち主はなんと、かつてジョーと敵対関係にあったウサギ団で・・・？！

第4話「アバクとハイドの因縁！　今、明かされる王来学園の真実！」

以前ガットルズとしてジェンドルに付き従っていた天王子ハイド。彼もまた、ヒミコと同様にアバクとともに行動していた。かつて王来学園の生徒会長だったハイド、そしてその同級生のアバク・ヒミコ。彼ら三人の因縁と悲しい過去が明らかに・・・。