ロミオの発明「ベビー・ビーム」のせいで、みんなが赤ちゃんになっちゃった！？まるで２歳児みたいになっちゃったキャットボーイとアウレットの相手をしながら、ロミオとの戦いに勝ってみんなを元に戻してあげられるかな？

子供たちの人形が盗まれる事件が起きた。ロミオが町中のぬいぐるみをロミオ人形に作り替えていたのだ！コナーのお気に入りのネコのぬいぐるみ、ニャン先生も、ロミオに見つかって、ロミオ人形にされてしまった…！

グレッグのペットのライオネルが、ロミオの「巨大化おやつ」を食べて、恐竜のように巨大なライオネオサウルスになっちゃった！ロミオはライオネオサウルスを操って、街を壊そうとしているけれど、どんなに巨大になっても、ライオネルのことを一番理解している飼い主のグレッグが立ちはだかる！

ナイトニンジャがベタベタ手裏剣のボールでサッカーをして、町中をベタベタにしようとしている！ナイトニンジャを止めようと、チーム・パジャマスク対クラブ・ニンジャリーノでサッカーの試合をすることに。だけどニンジャリーノの人数とベタベタ手裏剣に手こずるパジャマスク。チームワークの大切さに気づいて、カンフーサッカーに打ち勝つことはできるかな！？

ルナ・ガールが「月のぼんやりボール」を作り、触った子供たちはみんな催眠術にかかったようにフラフラと歩き回ってしまう。ボールを回収していたパジャマスクだが、キャットボーイが誤ってボールをゲッコーとアマヤにぶつけてしまい、二人ともふらふらになっちゃった…！？

グレッグが博物館に忘れてきてしまった宝物の月の石と、博物館にあった磁石の石が、ルナ・ガールに盗まれた！盗まれた石で、ルナ・マグネットがパワーアップしちゃった！月の石に気を取られちゃうゲッコーだけど、作戦に集中して、ルナ・ガールの暴走を止めることができるかな？

子供チャンピオンカップがナイトニンジャに盗まれた！キャットボーイはナイトニンジャに勝負を挑み、カップを取り返そうとする。ルナ・ガールも参戦した勝負で、キャットボーイはスピードだけで勝とうとするけれど、うまくいかない。落ち着いて戦って、見事カップを手にすることができるかな？

航空ショーを開く予定だった公園から、ナイトニンジャが飛行機を全部盗んじゃった！アウレットは、自分だけ空を飛ぼうとするナイトニンジャを止めたいけれど失敗してしまい…！？

アクシデントから、巨大化してしまったゲッコー。パレードの車を盗もうとしているルナ・ガールを見つけ、止めようとするけれど、次から次へと大混乱を引き起こしてしまい…！？

ナイトニンジャが、力の源の岩の中にある伝説のメダルを取り出そうとしているのを知ったゲッコーは、自分も欲しくなって、岩を割ろうとし、二人して大騒ぎ。パジャマスクの基地にぶつけて岩を割ろうとするナイトニンジャに、ゲッコーはみんなを危険に晒してしまったことに気づいて、心を改めて、ナイトニンジャに立ち向かう！