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見事、全国大会への出場を決めたヒイロ。
厳しい予選を潜り抜けた先に待っていたのは、強者のみが集う決勝トーナメントだった！
第1回戦の相手として現れたのは、フードを被った謎の少女。
「Ecila」と名乗る彼女の正体とは……。

全国大会に出場するため、ヒイロはマスターランクを目指す。
バトルに勝ち続けるヒイロだったが、あと一歩のところで届かない。
そんな時、ヒイロの前にグランドマスターランクの男――レオン・オーランシュが現れる。

「私に勝てば、君はマスターランクだ」

マスターランクの座をかけて、ヒイロの挑戦が始まる！

勉強、スポーツ、そしてシャドバ。どれをとっても隙がない少年、夜那月ルシア。
誰もが羨む才能を持つルシアだったが、彼にとって必要なのものは羨望の眼差しではなく、強さだけ。
自らを追い込み、ストイックに生きるルシア。
そんな彼の前に、プロプレイヤーである牙倉セイヤが現れる……。

いつものごとく、シャドバスタジアムでバトルをしようとするヒイロ。
すると、入り口の大型ビジョンには「本日 店舗大会！参加者募集中！」の文字があった！
初めての大会にワクワクしつつ、参加を決めるヒイロ。
すると、そこに遅れてカズキもやってくる。
いつもは友達、今日はライバル。2人のバトルが今、始まる……！

ヒイロの友達、天宮ミモリ。
ミモリは自分が『普通』なことにコンプレックスを抱えていた。
ミモリの憧れは、国民的アイドルの黒羽アリス。
黒羽アリスのポスターをぼぉーっと眺めていたミモリの前に、謎の少女が現れる。
少女は「アタシに勝ったら黒羽アリスに会わせてあげる」と、ミモリにバトルを申し込んでくるのだった……。

天青学園でのバトルで、連戦連勝を重ねるヒイロ。
そこに現れたのは、ヒイロの1年後輩である伊集院カイだった。
カイはヒイロの友達である進藤カズキを圧倒した後、ヒイロに挑戦状をたたきつける。
果たしてヒイロはカイに勝つことが出来るのだろうか……。

「超天才の策略、お見せしますよ」

静まり返った夜の公園で、ヒイロは夜那月ルシアと出会う。
ルシアもシャドバが好きなのだろうと思ったヒイロは、ルシアにバトルを挑む。
ヒイロの挑戦を快諾するルシア。その瞳は、刃のように鋭く細められていた……。

天青学園に通う少年、竜ヶ崎ヒイロ。
世間で大流行中のデジタルカードゲーム『Shadowverse（シャドウバース）』、
通称・シャドバをプレイしたいヒイロだったが、祖父であるシゲフミにスマホを買ってもらえないでいた。
ある日の朝、いつものように登校しようとしたヒイロは、自分を呼ぶ謎の声を聞く。
その声に導かれ、自宅の蔵に入るヒイロ。蔵の中には、真新しいスマホが置かれていた……。