藍蘭島に泥棒事件が起こる。しかも取られたものはお米や野菜などの食べ物ばかりだ。口元にご飯つぶをつけて起きて来たあやねに疑いの目が向けられる。あやねは疑いをあっさりと認めるが、食べたのはおにぎりや饅頭だけで畑を荒らしてはいないという。行人たちはふた手に分かれて食べ物泥棒の真犯人探しを始めるが…。

新しく藍蘭島の住民となった梅梅（めいめい）と河童の遠野さん。梅梅は極度の恥ずかしがり屋の性格を克服するために遠野さんと旅をしていたところを嵐に遭って藍蘭島に流れ着いたのだった。おつかいに行くという梅梅だったが心配になった行人とすずはついていくことに。二人は梅梅の恥ずかしがり屋を克服させようと努力するが…。

藍蘭島の南の森のぬし「しまとら」がすずたちの家にやってくる。しまとらによると近頃藍蘭島の猛者である西のぬし、東のぬし、北のぬしが立て続けに何者かに負かされる事件が起こったという。目撃情報によるとその何者かは食い意地が張っててケンカっ早く、色は緑で瞳はつぶら、頭には皿を乗せているというのだが…。

ある日目覚めたすずは自分に猫の耳としっぽがついていることに気付く。行人には犬の耳としっぽがついていて、とんかつは普通の豚になっていた。家の外では人間の姿になったにわとりの「はつ」が…。どうやら藍蘭島中の人間が動物の姿に、動物が人間の姿に入れ替わってしまったらしい。行人とすずは真相を解明しようとするが…。

しのぶは千影流忍者一族の三姉妹の次女。しかし一泊の剣の修行の旅が数ヶ月も戻ってこれなくなるほどの方向音痴。しのぶは迷っている間に行人が剣の達人である噂を聞きつけ、行人に剣の勝負を申し込む。行人は勝負を拒み続けるが、しのぶは勝負を受けてくれるまで帰らないと言う。しびれを切らしたすずは行人に勝負を受けるように言うが…。

藍蘭島が雷雨に襲われたとある日、すずや梅梅やあやねたちの元に一通の招待状が届く。それは藍蘭島の西の森の山奥にある温泉宿・月見亭の女将からのものだった。招待の目的が分からぬまま月見亭に向かう一同。出迎えた月見亭の女将・さくやはなんと１３０年以上前に作られたからくり人形だった…！？

すずたちに月見亭への招待状を出したのは女将のさくやではなかった。一同はそれぞれに来た招待状に「紅」のマークがあるのを見つける。それは藍蘭島でのみ出版されている人気ミステリー小説シリーズに出てくる怪人「紅夜叉」のものだった。いったい誰が何のために紅夜叉を名乗って招待状を出したのか！？一同が騒然とする中、ついに紅夜叉本人が姿を現す…！？

いつものように掃除当番を逃げ出したまち。逃げる最中に小さい地蔵に蹴躓いてしまう。頭に張ってあったお札が剥がれてしまった地蔵にはなんと変化妖怪狸又の幻十丸が封印されていたのだった。封印が解けた幻十丸は村に繰り出し、様々な妖怪変化で島民にいたずらを仕掛けはじめる。幻十丸のいたずらはやがて藍蘭島を大パニックにおとしいれて…。

ある日島の動物博士を自認するゆきのは青い鳥の羽を拾う。その羽が伝説の青い鳥のものだと確信したゆきのは友達になりたいと思い青い鳥探しをすることに。
すずととんかつを連れて青い鳥探しを始めたゆきのは森の奥でついに青い鳥を発見するが、逃げる青い鳥を追いかけている最中に足を滑らせて亀裂の底に落ちてしまって…。

藍蘭島には正式な学校がないため、寺子屋で読み書きなどを教えている。先生をしているのはちかげである。どういうわけか行人も先生をすることになった。寺子屋はワイワイとにぎやかだったが大の勉強嫌いのすずは逃げ出してばかり。先生のちかげはすずの勉強嫌いを直そうと、とある作戦を実行するが…。

すずが海辺で手紙入りの小瓶を拾ってくる。その手紙は、以前行人が妹の美咲に宛てて海に流した手紙の返事だった。あまりの奇跡に感動する行人。早速妹の美咲からの手紙を読んでみるが、どうやら大の方向音痴の美咲は海でも迷って遭難してしまったらしい。行人は遭難したらしい美咲を探しに行こうとするが…。

美咲を探すため藍蘭島から出たい行人だったが、島の外の渦を越えられない。そんな行人にオババはひとつだけ方法があると言う。嵐で藍蘭島に流されてきたのだから、嵐を利用して出れば良い。ただし島の守り神である海龍様に力を貸してくれるように頼むことが条件だった。海龍様がいると言われている海龍神社は龍神島にある。龍神島に向かう決意をした行人の前に数々の刺客が現われて…。

なんとか海龍神社の鍵を手に入れ、龍神島にたどり着く行人とすず。鍵を開けて海龍様に願いを伝えようとするが、ないしょで邪魔をしにきたあやねがあやまって海龍様のひげを抜いてしまった。島に地震が起こり、海龍神社も崩れ始める。間一髪逃げ出した行人たちだったが、願いを伝えることはできなかった…。それでも行人はひとりで島の外に出ると言って…。