リコとリムがクラスメートのケンとタマオと公園でバスケの勝負する約束をして家に帰ると、ハルカ母さんが獣医のフーコさんからあずかったかわいい子ネコがいました。
家の中を走り回る子ネコのライラを追いかけて、暗い屋根裏部屋に入ったリコとリムは古めかしいソファの上にとても不思議なかわいいものが置いてあるのをみつけました。

リコとリムのクラスにヴラドニアから転校生のカノンがやってきました。
キラキラした金髪がとてもきれいな女の子です。図書館で本を探していたナギサ姉は留学生パルスに話しかけられました。おばあちゃんが書いた本を探しているそうです。家の屋根裏部屋でパルスが探していた本をみつけたナギサはリコとリムからキルミンの秘密をうちあけられましたが･･････。

ケンやカノンと遊んでいたリコは、へんな雄猫ブサネコになつかれてこまってしまいます。
ブサネコが教室までついて来たのでルミコ先生に注意されてしまいました。
外国から帰ってきたハルカ母さんには３人がキルミンをつかったことを見つかってしまいます。でも「パパにはないしょ！」です。

森の洋館で母親のミサにタマオと仲良くするように言われますがケンが気になっているカノンはケンの家に行ってみます。でもお店にはケンのお父さんしかいませんでした。
なんだかあやしいリコとリムの秘密をさぐりに、ケンとタマオはリコ達の家に忍びこみます。
お庭の小さな入口から屋根裏部屋にたどり着いたケンとタマオは･･････。

迷子になったクラスメートのユカリの子ネコを捜すためリコ達はきぐるみモードに変身して、子ネコのまろのあとをたどり始めます。川岸で環境調査をしているミサ達と市長達からケンとタマオは川をきれいにするためにどうしたらいいか尋ねられたりしていましたが、リコとリムに会って一緒にまろを捜し始めます。

学園からの帰り道、パルスと再会したナギサは彼が探している本を書いたのはおばあちゃんだとうちあけました。一方アニマリアンたちはもみじフェスティバルを計画の舞台に選びます。リコたちとフェスティバルにやってきたナギサがパルスと輪投げや金魚すくいをしてドキドキしていると･･････。

リコたちが暮らす神浜市の郊外に広がる神浜樹海を横切るフリーウェイで、チーターがスピード違反をしたとか、神浜市は野生動物のうわさで持ちきりです。リコたちは神浜樹海のハイキングコースにどうぶつたちの調査に向かいますが･･････。

学校新聞のスクープを捜しているリムに、タマオがカトレア学園の学園七不思議と呼ばれる伝説があることを教えてくれます。リムたちはこっそりと夜の学園に伝説の秘密の取材に向かいます。ところが誰もいないはずの学園には怪しい人影が･･････。

いつものように言い合いをしてルミコ先生にしかられたリコとケン。ケンは店のお肉を届けた中華料理店から最近ネズミがいなくなったと聞いて、とても気になります。
中華料理店の屋根裏に忍びこんだケンは･･････。

５年２組のみんなと西森山へ写生遠足に出かけたリコたち。ミサからタマオをアニマリアンにするように言われたカノンですが、タマオはケイコにまかせて、ケンのハートを射止める作戦をたてはじめます。みんなが絵を描いていると子ザルが現れて･･････。

冬休みが始まり、今日はリコたちの家にみんなが集まってパーティーをひらくことになりました。ケンに誘われてやってきたカノンはヴラドニア風のお菓子を持ってきてくれました。御子神家の中でリコたちのヒミツを探し始めたカノンは･･････。

神浜港のカウントダウンイベントに来たリコたちは、ケガをした迷子の犬をみつけ、フーコ先生にみてもらいます。にぎやかな港で犬の飼い主を捜し始めたリコたちはディナークルーザー・喜代志丸で開かれるパーティーに「探偵ラッキー」を一目見ようとやってきたケンたちと一緒に･･････。