ナルトが自来也について修業を始めて３週間がすぎた。ナルトは修業の間に何度もたおれてしまうほどクタクタ。しかし自来也は、ナルトが未来の火影になるそしつがあるのだとしんじ、修業をつづけさせる。そして、ナルトに「口寄せの術」のコツを聞かれた自来也は、なぜかナルトに大好きなラーメンを食べさせたり、「好きな女の子にだきつけにいけ」と言ってサクラにだきつかせたりする。その後、自来也は「今から死んで来い」とガケからナルトをつき落とした。自来也のねらいは、死の恐怖（きょうふ）の中から、ナルトが自身の中にねむる「九尾のチャクラ」をひき出すことだったが…。

　ついに九尾のチャクラをひきだし、「口寄せの術」をものにしたナルト。それにより出てきたのは、ナルトがそのせなかに乗ってしまうほど巨大なガマガエルの「ガマブン太」だった。しかしガマブン太は「おまえのような子どもがオレをよびだせるはずはない」と、ナルトがよびだしたことをしんじようとはしない。くやしいナルトは、せなかから落ちないことでガマブン太にみとめさせようと、ひっしでしがみつくのだった。
　そのころ砂の里では、バキがテマリ、カンクロウ、我愛羅をあつめ、つぎの中忍試験で３人を「砂」から出すことをつたえていたが…。

　本選当日、砂の一行がとまる宿からぬけ出した我愛羅は、ナルトやリーたちがいる木ノ葉病院にやって来た。我愛羅はリーの病室にしのびこみ、ベッドでねむるリーをぶきみに見下ろす。そして、我愛羅があやつる砂はリーをおそいはじめた。
　その時、シカマルが影真似の術で我愛羅の体の自由をうばい、リーのピンチをすくう。だが我愛羅は、「ただ殺したいから殺す。オレのジャマをすれば、おまえたちも殺す」とぶきみに言いはなち…。

　いよいよ本選の日がやって来た。ナルトの一回戦の相手は日向ネジ。強いとひょうばんのネジが相手とあって、きんちょうするナルト。そんなナルトがむかったのは、下忍の合格をもらった演習場だった。そこにはぐうぜん、ナルトに思いをよせるヒナタのすがたが。ネジのしんせきであるヒナタに「ナルトくんは失敗するからこそ、そこに立ちむかっていく真の強さがある」と言われ、ナルトは勇気をとりもどすのだった。
　その後、本選会場にむかうナルトだったが、会場まではいがいと遠く、ちこくしそうになってしまう。そこへ木ノ葉丸があらわれ、会場までの近道をおしえてくれるが、トラブルにまきこまれてしまい…。

　いよいよ、木ノ葉隠れ中忍選抜試験の予選通過者８名による本選がはじまる日がやって来た。しかし、サスケはまだすがたを見せない。ナルトとサクラは、サスケの身に何かあったのではないかと心配する。
　一回戦はナルトＶＳ日向ネジ。ナルトにむかって「落ちこぼれは落ちこぼれだ」とつめたく言いはなつネジに対し、ナルトは「ぜってー勝つ！」と宣言する。そして戦いがはじまった！