翔と以蔵が土偶に近付くとツッコミ原人とびっくり原人がそれぞれ現れ、バトルが始まる。燃は２人は土偶を破壊するまで、原人たちのアジトの近くで隠れていたが、キング原人に見つかってしまう。燃と唯がレジェンドクラスターを使うキング原人の力に耐えられるのは１分だけ。翔と以蔵はツッコミ原人、びっくり原人を倒し、土偶もなんとか破壊。キング原人に３人の融合したトリックが迫る！

キング原人に敗れてしまった唯だが、意外にダメージもなく立ち上がる。以蔵は燃たちに土偶の写真を見せ、土偶を破壊すれば、原人たちはレジェンドクラスターを使えなくなると教える。ただし、破壊するには２体同時に攻撃しなければならず、そのためにはお互いの心を通じ合わせる技「バーニングソウル」が必要だという。燃たちはバーニングソウルを習得するため、お互いのヨーヨーを交換して特訓を始める。

燃たちの前に現れた原人たちは、ミスター・ヨーの研究所で１万年前の氷の中から蘇ったスピナー原人だった。ある儀式を行うため、燃のマッハフェニックス、翔のブレイズグリフォン、以蔵のサンダードレイクを破壊しようと狙っていた。以蔵はスピナー原人の秘密を探るため、燃と翔に協力を仰ぐ。

レジェンドクラスターがミスター・ヨーの基地崩壊とともに行方不明になった。以蔵が１人でレジェンドクラスターを探している中、燃は特訓に明け暮れ、翔は休暇をとっていた。すると燃の元に原人が現れ、マッハフェニックスを破壊しようとする。そして以蔵の前には、サンダードレイクを破壊しようと、別の原人が現れる。一方翔の前には、レジェンドクラスターを使いこなすキング原人が現れていた。

ミスター・ヨーの圧倒的な力の前にやられてしまう燃と翔。もうダメかと思った時、以蔵のオーラが飛んできて燃たちのピンチを救う。するとミスター・ヨーが急に別人のように激しく動き出す。レジェンドクラスターに魂を乗っ取られてしまったようだ。魔人が完全に目覚めていない今こそバーニングトリックを完成させる時。そしてチャンスは一度だけ。燃、翔、以蔵は心を１つに究極のバーニングトリックを発動する。

「憎しみだけではヨーヨーはうまくならない」と過去の以蔵は言う。すると以蔵は、戦いの中で憎しみ以外の感情も抱いたと自分の気持ちの変化を告白する。そして試練の扉に入ったのは、テイラーへの憎しみからではなく、燃たちの...その時、サンダードレイクの魂が以蔵の持つサンダードレイクに吸収され、本物になった。試練の扉を出た以蔵に、リンを使った経緯を説明して、テイラーへの協力を求める燃。以蔵はテイラーには協力できないとその場を立ち去る。燃たちは以蔵の協力を得ないままミスター・ヨーの秘密基地に潜入する。

ミスター・ヨーはレジェンドクラスターに眠る魔人の力を復活させようとしていた。一方、試練の扉に入り、サンダードレイクを手に入れた以蔵の前に、過去の以蔵が現れる。過去の自分と向き合う以蔵。すると「弱くなった」と指摘され激しく動揺する。その頃、試練の扉の外で以蔵の帰りを待つ燃たちの前に、正体を現したミスター・ヨーが現れる。レジェンドクラスターで戦うヨーの前に燃と翔は、２人のバーニングトリックで対抗する。するとレジェンドクラスターから魔人の手が出現し、燃たちのオーラを簡単に弾く。「バトルすれば魔人が復活する」というヒントを得たヨーは再び姿を消すのであった。

ミスター・ヨーはレジェンドクラスターを使って世界征服を高らかに宣言した。テイラーの元に集まった燃たちは未完に終わってしまったバーニングトリックを完成させて、レジェンドクラスターを奪還するよう命じられる。トリックを完成させるには、フェニックス、グリフォン、サンダードレイクの封印を解く必要があるという。サンダードレイクは伝説の雷を操るドラゴン、封印を解くのは唯ではなく、以蔵！？燃たちは輪瀬リンを使って以蔵にサンダードレイクの封印を解かせようとする。そしてサンダードレイクが眠る「試練の扉」に入った以蔵の前に意外な人物が姿を現す。

狼一刀斉を破った以蔵と翔。戦いの代償として以蔵はダイアルマースを失ったが、全てのレジェンドパーツがそろった。唯がレジェンドケースを開けようとした時、黒いオーラに吸い寄せられていく。そこへ現れたのはミスターヨー。高速スピードのトリックで燃たちを圧倒していく。そして以蔵の持つレジェンドボディーもヨーに奪われ、レジェンドクラスターがついに完成する。燃と翔は奪い返すため、それぞれ必殺トリックを決める。するとオーラが１つになりバーニングトリックが炸裂する！？

以蔵は狼と対峙していた。狼に破れた過去、それは狼を倒す事で前に進めると以蔵は考えていた。そこへ修行を終えた翔がやってくる。以蔵はボディーパーツ、翔は八方尾からもらったベアリング、狼は燃たちから奪ったレジェンドパーツを賭けてバトルする事になった。ただ、翔は狼のヒミツを見破っていない。スピナリオに忠告を受けるが、その時以蔵は乳母車に向かってトリックをしかける。

その昔、狼に破れた事で、よくも悪くも変わった以蔵。「人を信じようとしない」昔のまま変わっていない、今の自分の事を唯は考えていた。トップスピナーシュンの元で修行を始めた翔は、ヨーヨーを使わない修行に戸惑っていた。シュンの教えは「自分を表現する事」。そして自分のヨーヨーにその表現をぶつける事だった。

狼一刀斉は翔に襲いかかる。翔は自分でもわからないまま倒されてしまい、レジェンドパーツを奪われてしまう。燃と唯はその場にかけつけるが、唯はいつの間にかストリングを切られ、狼に逃げられてしまう。唯は狼が動き出した事を、かつてのパートナーであった以蔵に知らせる。八方尾は傷ついた翔の姿をみて、自分がレジェンドパーツを持っている事を白状し、自分の過去を語り始める。翔は狼に敗れた事で、自分の必殺トリックの必要性を感じ、トップスピナーシュンの元へ修行に行く。

残るレジェンドパーツは残り１つ。テイラーが示したサインは「緑に浮かぶ白い雲」。どこかで見た事があると思ったら、羽流星子の時の唐草模様...という事は八方尾が持っている！？。翔は八方尾がレジェンドパーツを持っていると確信し八方尾の元へ急ぐ。唯はテイラーからどんな手を使ってでも手に入れろという命令通りに、八方尾に厳しく迫るが、燃は八方尾との話し合いで解決しようとする。一方燃と別れ、八方尾を探していた翔の前に闇のスピナートリオ、狼一刀斉＆純次郎が現れる。