ゴーハ第７小学校に通う王道遊我はそれまでのキュークツなデュエルを変えるため、新しいデュエルのルール“ラッシュデュエル”を発明。同じ7小のルークやロミン、生徒会長のガクトといっしょに、ラッシュデュエルの面白さを世界に広めようと奮闘する。

そんな遊我たちの前に、デュエルのすべてを管理しようとするゴーハ・コーポレーションが立ちはだかる。そのゴーハ社の計画により、天才プログラマー・西園寺ネイルやエリートが集まる重騎デュエルクラブの六葉アサナなど、数々のライバルがデュエルを挑んできた！強敵たちとのデュエルに苦戦する遊我たちだったが、彼らとの激闘に打ち勝つごとに、ラッシュデュエルの面白さがみんなに伝わっていく。

そしてついに、ゴーハ社が主催するラッシュデュエル大会の決勝戦にて、大切な仲間であり最大のライバル同士である遊我とルークが激突。手に汗握る２人のデュエルは世界中の人々を熱狂させ、ラッシュデュエルの人気は最高潮に！その結果、７小のラッシュデュエルクラブにもグルグルという新たな仲間が入部した。

しかしそんな時、空から飛んできた超巨大要塞からゴーハ社の社長を名乗る兄弟たちが降り立つ。そして遊我たちに対してデュエルを挑んできた社長兄弟は、自分たちに勝利しないとラッシュデュエルを消滅させると宣言する！

果たしてラッシュデュエルの運命は…。
遊我たちのロードが行きつく先とは…!?