ノーフォーク基地でフッ化水素酸を入れたドラム缶から遺体が発見された。海軍下士官の制服を着ていたが、酸によって皮膚がただれており、身元の確認はすぐにはできない状態だった。しかし、ダッキーが左腕にイルカのタトゥーを見つけ、潜水艦の乗務員だと判明する。ところが、乗組員に行方不明者はいなかった。犯人が被害者に成りすまして潜水艦に乗り込んだ可能性があると気づいたギブスは、ケイトと共に航行中の潜水艦フィラデルフィアに乗船する。犯人の可能性がある人物は５人。順に尋問を行うが、指紋も人事記録のものとすべて一致し、手がかりは得られなかった。一方、アビーが遺体の顔を復元して５人の写真と照合したが、そちらも一致しなかった。他の潜水艦の可能性は考えられなかったことから、ギブスは照合した人事記録を細工できた基地の人事部に共犯者がいると考える。トニーと新人のマクギーが人事部に調べに行くと、２日前にフォックスという男が辞めていたことが分かる。