ナインがバードの新ベイの設計図を完成させ、マルチはベイクラフト作業に専念するため駒刃寿司に残ることに。フォースステージ会場に到着すると、ペルソナの目の前にはゲームのような空間が広がっていた。そこに現れたのは4Xアバターの黒須セブン。セブンとの対決方法は最新のフル4Xベイバトル。実際のベイは使用せず、ランチャー構えてシュートするだけでAIが計算して4Xでベイバトルを再現する驚異のシステムだった！

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相手の攻撃を受け流し無効化する万獣クインと、未知のエクストリームダッシュを放つ仮面Xが激しくぶつかり合い、勝負は決着がついた。試合後にクインはプロのベイブレーダーの在り方を語る。それはあるブレーダーの心に強く刺さり、自身の今までと今後を考えさせるものだった…。一方、頂上決戦に向けて自主練に取り組むバード。ベイの力を最大限に引き出そうと奮闘する彼の元へ、突然謎の来訪者がバトルを仕掛けてきて…！？

9999勝9敗の記録を持つ万獣クインの1万勝目か、仮面Xの無敗記録更新かを懸けたラストバトルに会場では大歓声が巻き起こる！大勝利宣言をする仮面Xだが、不敵に笑うクインは豊富なベイブレードの経験と知識を生かした戦略で迎え撃つ。バトル直前、クインは仮面Xのこれまでの戦法を見透かす発言をして…！？数多のブレーダーも息を呑んで見守る中、伝説のブレーダー万獣クインと仮面Xの闘いが始まる！！

ドリームズ2人目のブレーダーは、無敗殺しと呼ばれる珠羅レックス。猛々しさが持ち味で、血沸き肉踊るバトルを求めるファンからの支持は圧倒的。レックスの登場に観客からは大歓声が上がる！終始飛び跳ね暴れまわる、予測不能な猛攻を繰り返すレックスに対しペルソナは苦戦を強いられる。何が起こるか分からないバトルに仮面Xを心配するバードとマルチだったが、いつもの調子でバトルへ臨む仮面Xが取ったのはまさかの戦法で！？

オールスターバトル初戦を勝ち抜いたぱっくんと対戦する、ペルソナのセカンドブレーダーはマルチ。天才ベイクラフターとはいえ、プロブレーダーとしてあるまじき方法でコピーしたバードのベイを初戦で使用してきたぱっくんに対し、マルチは静かに怒りを燃やしバトルに臨む…！ベイのコピーの真相に迫る会場に戸惑いや非難が広がり高まる中、万獣クインの宣言で試合の続行が決まる…！！

シャッフルバトルフェスの投票で選ばれた者たちの闘い、オールスターバトルが始まる！ペルソナの対戦相手は、個人投票トップ3で組まれた即席チーム「ドリームズ」。そのチームの1人、生ける伝説と言われるブレーダー万獣クインによって、バトル形式が勝ち抜き戦へと変更されてしまう！ファーストブレーダー、バードが対峙するのは超人気ベイチューバーのぱっくん。取り出したのは、なんとバードと同じベイ…！？

エクスとバードが駒刃寿司の手伝いをしていると、Xタワーのチャンピオンチームの一員、七色シグルが突如店を訪れる。ペルソナのエクス以外のメンバーの実力を認めないシグルは、エクスにペンドラゴンへ戻らないのかと問いかけるが、エクスはシグルにバードとのバトルを提案する。更にそこへマルチも現れ、シグルとの意外な関係が明かされる…！シグルに対し、ペルソナはチームの実力を証明することが出来るのか！

バードのチーム「授業参観」の最終バトルは冥殿が出場。かつてXタワーの頂上に登り詰めると期待されたチームでプロブレーダーとして活動していた冥殿は、とある事情で現役を引退していた。過去の活躍を知る観客は冥殿の登場に盛り上がる。バトルの前に、ベイを手にしたまま意味深なことを告げた冥殿が、このシャッフルバトルフェスに参加する意図とは一体何なのか…！？そしてイベントは終わり、更なる闘いの幕が開ける。

シャッフルバトルフェス最終日を迎え、バードが所属するチーム「授業参観」が出場する。エクスとマルチの活躍もあり、ペルソナに票が集まっているが、チーム投票1位にはまだ届かず更なるアピールが必要！バードは助言を受けてカスタマイズしたランチャーに持ち替え、新たな相棒と共にバトルに挑む。万全の準備をしてきたバードはこのイベントで活躍し、ペルソナに票を集めることが出来るのか！？

チーム「マルチ様とアタシ」と「男独楽」の対戦は、ついに最終戦に！サードバトルはマルチと、Xタワー運営でもあるカドバーの対決！マルチは派手な演出でステージに登場し、アイドルの衣装で会場を盛り上げる。ペルソナがチームとして投票数を獲得することを意識し、目立とうと仲間のために動くマルチに対して、カドバーはバトル前から1人チームで活動していた頃のマルチの話を持ち出し始め…！？

シャッフルバトルフェス2日目、マルチが所属するチーム「マルチ様とアタシ」と、チーム「男独楽」の闘いが始まる。ファーストバトルで登場したゾナモスは、得意のナゾトキベイバトルを提案してくる！トグロはナゾトキに対し乗り気ではなかったが、会場の盛り上がりにも押されて受けることに。続くバトルでは、ゆに、そしてペルソナとも因縁深いあの男が激突！！果たして2つのバトルのゆくえは…！