ナインがバードの新ベイの設計図を完成させ、マルチはベイクラフト作業に専念するため駒刃寿司に残ることに。フォースステージ会場に到着すると、ペルソナの目の前にはゲームのような空間が広がっていた。そこに現れたのは4Xアバターの黒須セブン。セブンとの対決方法は最新のフル4Xベイバトル。実際のベイは使用せず、ランチャー構えてシュートするだけでAIが計算して4Xでベイバトルを再現する驚異のシステムだった！

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仮面X対パンのバトルが始まる。キングは、ズーガニックのメンバーとの出会いを語り、仲間達が真の強者であることを思い知るだろうという。煽ってくるパンに対して仮面Xはどう出るのか！ペルソナはシャッフルバトルフェスで活躍し、票を集めることが出来るのか！？各チーム最後の対戦は、まさかのブレーダーがついに登場！4XマスコットAIのイチゴーちゃんは一体どうやってバトルをするのか！？

ついにシャッフルバトルフェスが開幕！！現役プロだけでなく引退したプロやスポンサーからもブレーダーがイベントに参加し、まさかの編成チームが出揃う。オープニングマッチから早速、未知の組み合わせチーム同士が激突しアツい闘いが繰り広げられる。誰も予想しなかったまさかのブレーダーまで参入する大注目チームの対決と、メンバーがバラバラになったペルソナの、投票のゆくえはいったい！？

バードがアマチュアアリーナを通りかかると罵声が耳に飛び込んでくる。中ではなぜか石山が多数のアマチュアを相手に、負けたブレーダーのベイを壊すこともなくただひたすら闘い続けていた。バードに気づいた石山は煽りながらバトルを挑んでくるが、幾度ものバトルを終えて明らかに限界を超えており、何か事情があるように思い詰めた表情をしている…。やがて自分のベイを持ち、あらぬ行動に…！そこへまさかの人物まで現れ…！？

既存のチームをバラバラにし、運営が新たにランダムでチーム編成を行うイベント「シャッフルバトルフェス」が開催される。バトルの勝敗ではなく人気投票によって順位が決定し、最終的に最も人気のあるチームと、人気のある個人ブレーダー上位3人で組むチームでのバトルが行われる。結果を出せばXタワー頂上への挑戦に近づけるこの大会を前に、バードは今までのペルソナの闘いを振り返り、1人考え込む様子で…。

ペルソナ対ユグドラシル、チームの勝敗が決まるバトルがついに始まった。仮面Xは得意のエクストリームダッシュで仕掛けていくが、バーンは余裕の笑みで迎え撃ってくる！自身の最大の武器でもあるスピードでバーンに上回られ、ピンチに追い込まれた仮面Xは、「ベイタイムシフト」を起こしたバーンとの戦いに果たして勝利することができるのか…！？ペルソナのチーム存亡の行方はいかに！？

ユグドラシルとの決戦、ついにバーンがヘリで駆けつけ、バトルアリーナに現れる。緊張感が場を包む中、バーンは闘えることに興奮し、突如仮面Xを抱擁する！？負けたチームは解散という無茶な提案をしてくるバーンに対し、なんと仮面Xは提案を飲んでしまう。Xシティ中を賑わせた謎のベイから更に進化を遂げた最速のベイがついにそのベールを脱ぐ！「最速」対「最速を超えた最速」のバトルが始まる…！

ユグドラシルとの闘いは、いまだにバーンの姿が見えないままセカンドバトルを迎える。2戦目のバトルはマルチ対ゆに。ゆにはマルチに、お互いインフルエンサーの引退をかけて闘うことを提案してくる。リスクある提案に対し、マルチは臆さず受けて立つ！序盤から激しいアタックを繰り出し、派手にバトルを進め、マルチを追い詰めるゆにに対しマルチも反撃を始める。インフルエンサー同士の対決、果たして勝つのは…！？

Xタワー50階まで登り詰めたペルソナと、強敵揃いのチーム「ユグドラシル」との対戦が決まる。しかし、入場コールが終わってもステージに肝心のリーダー・不死原バーンの姿は無い。ユグドラシルはどのような作戦でペルソナに挑んでくるのか！？ファーストブレーダーのゾナモスはペルソナに変則ナゾトキバトルを提案してくる！ゾナモスお得意の「ナゾ」が再びペルソナに襲いかかる！

「日ごろ見た目を気にしなさすぎ！」とマルチに叱られ、エクスとバードは身なりを整えるためブレーダー御用達のアパレルショップ「ブレーダーズドレス」へ連れてこられた。バードが店で服を探していたところ、アンバサダーと名乗る人物からプロブレーダーとしての魅力がないと言われてしまう。さらに、ブレーダー特性の測定のためのシュートも「期待はずれ」と言われてしまい、納得いかないバードはバトルを申し込む…！

Xタワー上層階を目指すためにはバードの人気を上げることが重要！ペルソナは駒刃寿司の新商品を考案しつつ、ベイの特訓をする動画の配信をする事に！バトルで負けたブレーダーが個性的なオリジナル寿司を試食し、レビューをしていくが、エクスとマルチの考えたお寿司は上手くいかず。そんな2人に対し、バードはまさかの才能を発揮する！一方、エクスはお寿司を見てふとペンドラゴンの頃の思い出を思い浮かべ…。