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ベイクラフトに励むマルチは、休憩がてらキングの母ジョカとベイバトルをすることに。ベイブレードの新時代への不安を吐露するマルチがジョカにもらったアドバイスとは…？一方、実力原理主義と言われるソリダスタワーに電撃移籍したファランクスは、デビュー戦を迎える。観客や選手から厳しい意見が飛び交う中で、石山の堅実なバトルが生み出した結果は…？そして、試合後の石山を待ち受けていた人物は一体…！？

ベイクラフトの修行をすべくマルチが訪ねたのは、万獣一族が住むアニマルキャッスル。キングやクインの家族の手厚いもてなしにマルチは圧倒される。クインが言っていた、ベイクラフトの本物の天才は意外な人物で…！？始めは半信半疑だったマルチだが、その人物が作ったベイの設計図を見て敗北感を感じる。確かな実力を理解し自分の現状を打ち明けたマルチは、自身の作ったベイを率直に評価してほしいと願い出る…！

ベイクラフターとしての壁にぶつかったマルチは、かつてベイクラフターの資格を取るために通っていた私立ベイアカデミーを訪ね、当時ベイクラフトの技術や知識に対するマルチの自信をへし折った恩師の目ヶ岡先生に、もう一度ベイクラフトを教えてほしいとお願いする。マルチの願いに応じて目ヶ岡が開催したベイクラフターの神髄を教える特別授業で、マルチは戸惑いながらも徐々にベイクラフトの大事な基本を思い出していく。

仮面Xは、勝負に自分が勝ったら命令を聞いてもらうというテンカの条件をあっさり受け入れ、手配してきたダブルエクストリームスタジアムでバトルに臨む！仮面Xの勝利を期待し前のめりなバードに対し、マルチは自分が作ったベイが通用するかと不安げにバトルを見守る。ブレーダーとしてもベイクラフターとしても全く足りてないというテンカの指摘に、何も言い返せず俯くことしかできないマルチが下した決断は…。

新時代への突入を確信するバーンは、ゾナモス、ゆにと共にユグドラシル製薬の孤島の研究所に来ていた。突如現れた来訪者は仮面Sの詳細を知っているようで…？一方駒刃寿司では、テンカがここにいる全員を倒したら仮面Xとバトルをさせてもらえるという以前の約束を再度持ち出し、マルチに宣戦布告！一番の自信作で来いと挑発するテンカにマルチが立ち向かう！さらに、張り詰めた空気の中、ついに真打ちが登場する！！

ペルソナからのサードブレーダーは体調不良の仮面Xに代わり、謎の仮面S！キングとバーンは、以前2人の勝負に突如割り込んできたそのブレーダー相手に、ランチャーを構える。白熱するバトルの中、勝負を仕掛けたのは…！？そしてB4から世界初公開された新スタジアムのテストバトルに、会場は大盛り上がり！ワクワクが止まらないバードをよそに、今までのベイの戦い方を覆すギミックを目の当たりしたマルチは焦りをにじませ…。

トリプルバトルのセカンドブレーダーは、マルチ、パン、ゾナモスが選ばれた。ゾナモスはバトルの前にいつものように出そうとしたベイナゾをマルチに断られ、あっさり引き下がるが、せめてと作ったナゾを披露する。一度は断ったはずのベイナゾを、名探偵マルチが推理ショーで解き明かす！迎えたサードセット、大量のあんこクリーム寿司とのラストバトルに挑んでいた仮面Xに異変が…！？そして、その様子を見て現れた人物とは！？

ついにペルソナの次の試合が決定！詳細が不明のままXタワーに向かうと、招集されたのはペルソナ、ユグドラシル、ズーガニックの3チームだった。一方、仮面Xは控室に用意された差し入れと思われる大量のあんこクリーム寿司を一心不乱に食べ始める…！そんな中、発表された初のバトル方式に、会場ではどよめきが生まれる。バトル中相手を観察し攻撃のタイミングを計るバードだが、思いも寄らないハプニングが起こってしまい！？

駒刃寿司に突然現れた、白星テンカ。仮面Xとのベイバトルを目的に来るも、当の仮面Xは不在。この場にいる全員に勝ったら仮面Xとのバトルを許可してほしいと言う。独特な構えと、未知のベイを使うテンカにペルソナは立ち向かう！警戒するマルチは、仮面Xを倒すだけが目的ではないだろうと問いかける。にやけた笑みを浮かべるテンカに、マルチは負けじと強気に振る舞うが…？ベイブレードの新時代はまさに今、動き出している！！

フェニックスラダーを試したいバーンの要望に応え、石山はユグドラシル製薬を訪れる。ベイバトル後、突如警報が鳴り響き、バーンの新ベイ完成祝いに謎の人物が飛来！？一方、マルチは新ベイの案が思いつかず悩んでいた。ベイから離れてみることや、同じベイクラフターに相談することを勧められ模索する。そんなある日、一緒に仕事をする機会を得たマルチとシグル。仕事後にマルチを呼び止めたシグルには、思うことがあり…？