ポケットモンスター

ポケモンジムでトレーナー対決に挑戦したサトシ。ついに岩ポケモンの使い手タケシを打ち破り、グレーバッジを手に入れることが出来た。
そして、仲間を一人増やした一行は、次に目指すハナダシティへの近道を通るためオツキミ山の洞窟へやってきた。しかし、洞窟の入口でものすごい数のズバットに襲われている一人の研究員を見つけたサトシたちは、ピカチュウの電撃で彼を助ける。助けられて大感激の科学研修員リカオは、サトシたちを洞窟の中へ案内してあげることにしたのだが、そこには傷ついたポケモンたちがいっぱい。
その理由は、月の石を探して人々がどんどん山の中に入ってきて、ポケモンの生息地が荒らされているからだというのだ。
と、サトシたちの目の前を、両手で小さな光る石を抱えてトコトコと歩いていくポケモン…ピッピが現れた。

トレーナーバッジを集めるため、サトシはハナダシティへと向かっていた。ハナダジムでポケモン対決に臨むのがその目的だが、なぜかカスミはハナダシティには行きたくないと言って、途中で姿を消してしまう。
そんなカスミのことはお構いなしで、サトシとピカチュウはハナダシティのハナダジムへと一目散で向かっていく。到着すると、外見はヘンテコな水族館のような建物。さらに、建物の中に入ってみると、これがまた美人三姉妹によるシンクロナイズドスイミングショーが行われていて、サトシ・ピカチュウはすっかり演技に夢中になってしまう。
さて、果たしてここが本当にハナダジムなのか？目の前で演技をしている美人三姉妹の正体は…？そして、サトシは新たなバッジをゲットできるのか…？

2つ目のバッジをゲットして、サトシたちは威風堂々と次の目的地、クチバシティへと向かっていた。その途中、今まで一度もポケモン対決で負けたことがないという猛獣使いのアキラというトレーナーがいるという噂を耳にするサトシたち。
10連勝中で勢いが止まらないサトシにとって、これは何よりの対戦相手とばかりそのジムへと向かう。ついたジムの正面にはデカデカと「ポケモンリーグ非公認ジム」と書かれ、そして、巨大な電光掲示板には「ただいま98連勝中」と並々ならぬ自信をアピールしている様子。見事100連勝の暁には、ポケモンバッジ入手の旅に出るというアキラは目標達成寸前。
さて、10連勝中のサトシと98連勝中のアキラの対決はどちらに軍配が上がるのだろうか？

深い深い森の中、その上霧であたりは真っ白闇。何とサトシたち３人は道に迷ってしまった。仕方なくあきらめてしばし休息することにしたが、サトシは薪を拾うため更に森の中に入っていった。
そこに偶然、一人の少年が5人の同級生に囲まれていじめられている所に出くわしてしまう。その少年たちは、話の内容からポケモントレーナー予備校・ポケモンゼミナール（通称ポケゼミ）の生徒らしいことがわかる。ポケゼミとは、卒業すると実技試験なしでポケモンリーグに出場する資格がもらえるため、ポケモントレーナーを目指す子どものあこがれの予備校であるのだが、超金持ちの子どもしか入学できない「噂の名門校」でもある。
しかし、生徒達の表情に暗い影が見えるのには何か訳があるようだ。

またまた道に迷ったサトシ一行。吊り橋から川に落ちたり、落とし穴があったり、網にひっかかったりと悪戦苦闘しながらようやくたどり着いたのは、地図にも載っていないポケモン落ち武者村であった。
この村では、戦いに傷ついたり、捨てられたポケモンたちが逃げてきて療養しているのだが、そんなポケモンたちの面倒を看ているミドリと言う心優しいお姉さんであった。
そんな姿に心打たれたサトシたちは、傷ついたポケモンたちの世話をしようとするのだが、その時、ロケット団たちもこの村へ向かっていた。