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ゴーハ社がラッシュデュエル大会を開くと聞き、ルークは大会を勝ち抜いてデュエルの王になると宣言。大会へは３人のチームで参加しなければならないが、なぜか遊我は大会へ出ないという…。遊我の態度に納得がいかないルークだったが、大会へ向けマキシマムカードを発掘しようと坑道を訪れる。そこでルークは、宇宙服を着た奇妙な３人組と遭遇する！

突然、生徒会と蒼月流からの卒業を申し出る蘭世。思いがけない蘭世の行動にとまどうガクトは、卒業の条件として、ラッシュデュエルで自分を倒すことを蘭世に課す。蘭世は、これまで主(あるじ)と敬(うやま)い、献身的に仕(つか)えてきたガクトとのデュエルで、なぜか異常なまでに挑発的な態度をとる。そこには蘭世の特殊能力!?である“蘭世アイズ”のほかにも、秘めた想いがあった…。

プリンセスＧが引退する!!どうやら、ラッシュデュエルを認めたことで、プリンセスＧの所属先であるゴーハミュージックを解雇(かいこ)されたらしい…。このニュースを知ったロミンは、ラッシュデュエルをやめると言い出し、最後の対戦相手として遊我を指名する！「これが私のラスト・ギグ！」

激しく闘いの火花を散らす超魔機神マグナム・オーバーロードと幻竜重騎(げんりゅうじゅうき)ウォームＥｘカベーター！お互いに熱いデュエルを楽しむ遊我とアサナだったが、アサナの愛機・Ｒ６(アールシックス)に限界の時が訪れる。それでも引けない理由がアサナにはあった。取り戻したい、誇りがあった。

地下最深部で遊我たちは、廃棄された試作型デュエルディスクを発見する。重騎デュエルクラブの秘密にたどり着いた遊我たちの前にアサナが現れ、遊我にデュエルを申し込む。それは、ラッシュデュエルと重騎道の誇りを懸けた最後の闘い。今、決戦の火蓋(ひぶた)が切られる！

次の相手は重騎デュエルクラブ参謀(さんぼう)を務める加山(かやま)シュベール！ハトラップを使った罠だった『ラッパデュエット大会』に誘い込まれた責任を取る、と意気込むルークが進み出る。しかし、重騎に乗り込んだシュベールは、自分の左肩に乗せた参謀の一角(いっかく)である鳩・ハトラップが相手をする!?と言い出す…。

地下に広がる重騎闘技場へとたどり着いた遊我たちの前に、またしてもギャリアンが立ちふさがる。デュエルを挑んでくるが、なぜかボロボロのギャリアン…。見かねた蘭世の妄想(もうそう)が、ギャリアンに対しても発動してしまう！「この勝負、ギャリアンに代わって――この七星(ななほし)蘭世が譲り受ける！」というトンデモ展開に!?

遊我たち不在のロード研究所に迫る巨大な無限軌道。その正体は重騎デュエルクラブのメカニック、象明寺(ぞうみょうじ)キャタピリオだった！圧倒的な解体の技で研究所に詰め寄るキャタピリオ。だが、その暴挙を許さぬ者がいた。美しい華には正義がある。上城大華、見参！

遊我はアサナたちの秘密を探るためカイゾーとセバスチャンをネイルの元へと送り出す。雨に降られ雨宿りをしていた２体の前に、重騎デュエルクラブからの刺客にして地底人!?フィンガー地下子(ちかこ)が現れ、セバスチャンたちにデュエルを仕掛ける！

ゴーハ６小へ転校させられてしまった遊我たち。７小生徒会長の立場を失ったガクトに『生徒会長欠乏症(けつぼうしょう)』の症状が…。７小生徒会へ復帰するため、重騎デュエルクラブとのデュエルを決意したガクトの前に、蘭世と凛之介を６小へと連れ去った田崎ギャリアンが立ちふさがる！