「ギャングリーンギャング！　その１」
パワパフガールズＺの３人は、ユートニウム博士、ケン、ピーチとレストランで食事中。そこに、モンスターの５人組、ギャングリーンギャングがやって来た。サラダに虫を入れて、タダで食事をしようとするギャングリーンギャング。それを見たガールズは、５人をこらしめることにする。

「ギャングリーンギャング！　その２」
サッカーの決勝戦で、メイヤー市長のかわりにトロフィーをわたすことになったバターカップ。それをねらい、ギャングリーンギャングはいろいろな作戦でバターカップをおそう。しかし、どの作戦もうまくいかなかったため、ついにグランドに乱入することに…

「狙われたファッションショー！」
有名デザイナー・シリノジャンコのファッションショーのモデルにスカウトされたガールズ。みやことももこはよろこぶが、かおるはイヤがって引き受けなかった。ステキな服を着るため、変身ベルトをはずすみやことももこ。ところがそのファッションショーにはモジョがモデルに変装して忍びこんでいて…。

「男！ラーメンモンスター！」
50年間しょうゆラーメンひとすじにこだわってきたおやっさんは、食べる前から薬味をたくさん入れて味を変えてしまう客にかなしい思いをしていた。すると、そのラーメンがモンスター、ヌードラーに変身。ヌードラーはおやっさんに恩返しをするため、みんなにラーメンの正しい食べかたをムリヤリ教えはじめた。そこへガールズがかけつけるが…。

「哀れ！プリンセスの秘密　その１」
夜中にあらわれたプリンセスが、チアガールのようなかっこうでさわぎはじめた。そこでガールズが出動。彼女をつかまえて、研究所でもとの白金姫子のすがたにもどした。ところが次の日の夜も、そのまた次の日の夜も、プリンセスはあらわれて…。

「哀れ！プリンセスの秘密　その２」
姫子の家に忍びこんだガールズは、あまりにも大きなお屋敷のために迷ってしまう。しかし、ビデオがいっぱい置いてある部屋を発見。そこには姫子のお姉さんの神子（みこ）のビデオばかりあり、姫子のビデオは少ししかなかった。ガールズは、姫子がお姉さんよりも目立って、お父さんやお母さんにみとめてほしかったことを知るが…。

「シャッターチャンスを逃すな！」
新聞部のジェシー・木戸は、パワパフガールズＺの記事を書いた新聞を配るが、みんなに見てもらえない。それは、かんじんのガールズの写真がどれも小さいから。いっぽうモジョは、その新聞の写真を見て、ガールズを遠くからねらいうちして倒すことを、思いついていた。

「兄弟愛！電波モンスター」
普段は仲の良い兄妹であるメイヤー市長と校長先生。だが、ショートケーキとみつ豆のどちらがおいしいかを携帯電話で話しているうちに、ケンカになってしまう。そして、その携帯電話の電波から、電波モンスターがあらわれた。電波モンスターは、街中の携帯電話をあやつって、大あばれする。

「モンスター・タッグバトル！　その１」
屋台でパワパフガールズＺにやられたことをグチるギャングリーンギャング。そこに、モジョとファジーもやって来た。おたがい、ガールズのことをグチりあった彼らは、７人で力を合わせて戦うことにする。いっぽうガールズは、最近だらけていて、モンスターが出たと聞いても出動をめんどうくさがっていたが…。

「モンスター・タッグバトル！　その２」
ガールズを月に飛ばしてしまう作戦が成功し、東京CITYでやりたいほうだいのモジョ、ファジー、ギャングリーンギャング。しかし彼らは、誰がリーダーなのかでもめはじめてしまう。そのころガールズの３人は、月で反省して仲直りしていた。そして彼女たちは、東京CITYの平和を守るために、心を入れかえて戦うことをちかうのだった。

「哀しきピアノレッスン！」
もっと教養を身につけたいと思ったモジョは、ピアノ教室に入りこみ、ピアノを弾きはじめました。しかし、そのあまりの下手さにピアノが怒って、モンスターになってしまう。ピアノモンスターは音符爆弾を発射して街で暴れ回り、ピアノがうまい人を見つけるとその人を飲みこんで、大きくなっていく。出動するガールズだったが、つかまっている人がいるため、手を出せなくて…。

「最強！キーン先生」
授業中にモンスターがあらわれるたびに、いいわけを考えて出動していくガールズ。キーン先生は、あまりにも授業をぬけ出す３人の勉強がおくれてしまうことを心配していた。そしてある日、モジョがあらわれたと聞いた３人は授業をぬけ出そうとするが、「保健室に行かなくてもすむように」と、キーン先生が薬を用意して、外へ出してくれなくて…。

「ラウディラフボーイズ！　その１」
パワパフガールズＺに勝てるモンスターを作り出すため、研究所に忍びこんでケミカルＺを盗むモジョ。その時、ももこがジュースを飲むのに使ったストロー、みやこが耳そうじにつかった綿棒、かおるがはいていたくつ下もいっしょに盗んでいく。ガールズのにおいがするそれらを、より強力なモンスターを作るための材料にしようと考えたのだ。それらとモジョのヒゲ、わき毛、すね毛、鼻毛をまぜてモンスター製造マシーンに入れると、ブリック、ブーマー、ブッチという３人の男の子、ラウディラフボーイズが誕生し…。

「ラウディラフボーイズ！　その２」
町に出ていったラウディラフボーイズは、街中でいろんなイタズラをくり広げる。出動するガールズだったが、ツバとばしストロー、耳アカ綿棒、においつきくつ下ブーメランなど、きたないワザをうけてしまう。さらにラウディラフボーイズは、モジョをけしかけて、モジョロボを発進させ…。

「プヨプヨアヒルのモンスター！」
ピーチは川原でおもちゃのアヒルのモンスターに出会う。不思議なことに黒いオーラのにおいを感じないそのモンスター。ピーチについて研究所まで来てしまったので、プヨと名づけることに。すっかり友達になって、楽しい日々をすごすピーチとプヨ。しかしプヨは、入浴剤を食べてどんどん大きくなってしまい…

「嫌われ野菜の大脱出！」
ももこはセロリが、みやこはピーマンが、かおるはニンジンがきらい。ケンも八宝菜に入っている野菜が食べられない。その野菜をよけて食べていたら、それらがモンスターとなってあばれ出した。人間にきらわれているのなら自分たちも人間をきらってやると考えたモンスターたちは、世界中のセロリ、ピーマン、ニンジンをつれて地球を出ていってしまう。

「最凶最悪のカレ！　その１」
ケミカルＺから生み出された中でも、ひときわ大きな黒い光が、石のひつぎに封じこめられていた最凶最悪のモンスターであるカレを目覚めさせてしまった。カレは自分が封じこめられているひつぎを開けるため、ミイラ男を作り出す。そして、ひつぎを開けるには白い光のパワーが必要ということで、ミイラ男は国際科学研究所に向かうのだった。

「最凶最悪のカレ！　その２」
タコ焼き屋をおそいはじめたミイラ男。それを聞いたガールズは、モジョのしわざだとかんちがいして、公園でタコ焼きを食べていたモジョをやっつけてしまう。そこにあらわれたミイラ男は、モジョをあっさりとたおしてガールズにおそいかかり、白い光のパワーを吸い取ってしまうのだった。

「歌舞伎モンスター、恋の道！」
アイスクリーム屋の娘に恋をする落語家。だが、娘のお父さんにつきあうことをゆるしてもらえない。人に笑われる落語のような古典芸能はダメで、人を感動させる歌舞伎ならいいというのだ。そして落語家は、カレがまきちらした黒いコナのパワーで、歌舞伎モンスターになってしまい…。

「昆虫王は誰だ！」
カブトムシを戦わせる「インセクターバトル」。その大会で勝つためには、ケンとカブトムシのコウヘイの心がひとつにならないといけないと、かおるはケンに特訓することに。いっぽう前回優勝のロッドは、勝つことにこだわりすぎて、ルール違反も気にしなくなっていた。そして、カレの黒いコナがロッドのカブトムシ・コーカサスをモンスターにしてしまい…。

「ケンの友達探し！　その１」
多すぎる宿題に苦しむももこたち。いっぽうのケンは、大学院を卒業して博士号まで持っているため、学校に行く必要はなかったが、そのかわり友達はいなかった。学校とは勉強するだけでなく、友達と楽しく遊んだり、はげましあったり、ぶつかりあったりして、ともに成長しあうところだという３人の話を聞いたケンは、友達を作るために小学校へ入り直すことにする。

「ケンの友達探し！　その２」
サッカーの試合ではり合うケンとクラスメイトの丈。丈ががんばるほど、ケンもがんばりたくなる。そこへモジョがあらわれた。みんなにバカにされて頭に来たモジョは、モジョロボを呼び出す。あばれるモジョロボにふみつぶされそうになったケンだったが、それを丈が助けたため、２人の間に友情が芽ばえることに…。

「イタズラ文房具！」
カレが放った黒いコナのせいで、みやこの使っていたペンと消しゴムがモンスターになってしまった。イタズラ好きなペンのモンスターのペンナは、消しゴムのモンスターのゴンマを連れて東京CITY中をラクガキして回る。みやこはそれを追いかけるが、ペンナとゴンマがケンカをはじめてしまい…。

「花・はな・ハナ！」
クリスマス前の浮かれた東京CITYのかたすみで、１本だけさみしく咲いているクリスマスローズ。カレのはなった黒いコナで、そのクリスマスローズはモンスターとなり、さみしさをなくすために仲間を増やそうと、たくさんの種を放って東京CITY中を花だらけにしてしまう。出動するガールズだったが、ももこの鼻とベルトにも花が咲いてしまい…。

「サンタさんを救え！　その１」
クリスマスでにぎわう東京CITY。たのしそうな家族連れを見て、買い出し中のケンはさみしそうだった。研究所では、ユートニウム博士とももこたちがクリスマスパーティーのかざりつけをしていたが、ケンは「サンタなんていないから手伝わない」と言い出す。実はケンは、３年前からクリスマスプレゼントをもらっていなかったのだ。ケンのことが気になるももこたちは…。

「サンタさんを救え！　その２」
宇宙飛行士として宇宙ステーションで働いているケンのママ。しかも衛星通信の調子が悪くて、顔も見えず、声もとぎれとぎれでしか聞くことができない。さらに「今年も帰れない」という通信に、「やっぱりサンタさんはいない」と落ちこむケン。ケンはサンタさんへの手紙に「ママと会いたい」と書いていたのだ。いっぽう、モジョはプレゼントを横取りしようと、サンタさんをつかまえていたが…。