黒須ゼロが開催を宣言した真・Xタワーウォー。果たしてどんな刺客が待ち受けているのか考えを巡らすペルソナだったが、バードは誰が相手でも関係ないとチームに気合を入れ、真・Xタワーへと出発する。ファーストステージの舞台に到着すると、そこに待ち受けていたのは黒須一族最強のブレーダー、黒須ワンだった！まさかの相手の登場に驚くペルソナだったがワン曰く、先客が来ているという。果たしてその先客の正体とは…！？

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黒須一族の一人、エイトと激闘を繰り広げるエクス。エイトのベイ、クロックミラージュは従来のスタミナタイプとは設計思想が根本から異なり、時をも止めるとエイトが豪語する未来技術を搭載していた。果たして勝負の行方は！？その夜、黒須一族のベイは最先端にして最高であると語るナイン。マルチが作るベイが通用するとは思えないと断じる。一方、銀狼たちのもとにも黒須一族が現れ、新たな闘いの幕が上がろうとしていた…！

駒刃寿司に突如現れた黒須ナインは、黒須一族を倒さなければXシティは滅亡するとペルソナに告げる。その直後、店は激しい揺れに見舞われ、外へ飛び出した一行が目にしたのはXシティ全体を震撼させる衝撃の光景だった！さらに空には黒須ゼロを名乗る人物の巨大ホログラムが出現し、ベイブレードは滅亡すると宣言。自身の壮大な計画を実現するため9人の子供を派遣したと明かす。ナインがペルソナの前に現れた真の目的とは…！？

白星決闘が幕を閉じ、日常を取り戻したXシティ。再び3人となったチームペルソナのファンミーティングには多くのファンが詰めかけた。イベントの目玉企画、ペルソナに挑めるチャレンジバトルで挑戦者を次々と倒す仮面X。しかし、100人目に現れたのは一筋縄ではいかない強者だった！一方、巷ではプロのイベントに現れては挑戦を仕掛けるプロブレーダー狩りの噂が広まっていた…。謎めいた100人目の挑戦者の正体は一体！？

白星最終決闘は、緊張感と熱気に包まれたまま、いよいよ最終局面へ。観客や特別席のブレーダー仲間、関係者たちも固唾をのんで見守る中、思いがけない人物がペルソナのファイナルブレーダーとして登場！会場は驚きと歓声に大きく揺れ、ファイナルセットが開戦。過去の因縁、揺るがぬ信念、仲間との約束が交錯し、かつてない激しいぶつかり合いと、限界を超えた力が火花を散らす。そして、運命のその瞬間が、ついに訪れる…！

テンカはオメガと闘いたい気持ちを抑え、ペルソナが絶対に勝つためにエクスへオメガとの対戦を促す。しかし、テンカの本当の思いを知るエクスたちの後押しを受け、テンカは新ベイ、サムライカリバーを手に自らオメガとの直接対決に挑む決断をする！一方オメガも新ベイ、ペガサスブラストを投入し桁違いの実力で立ちはだかる。白星流の元師範代と現師範代による至高の親子対決。果たして白星流の必勝不敗を手にするのはどちらか！？

白星最終決闘ペルソナVSゾディアックのセカンドセットは、バードとランツによる因縁の対決！バトル前、ランツは過去にわざと負けてやったことを持ち出してバードを見下すように挑発する。しかし、バードはベイをなめている奴なんかに絶対に負けないと宣戦布告。実力では到底敵わない超頂上の相手に、誰も予想し得なかった驚きの奇策で挑む！圧倒的な実力差を覆す真の力を示せるのか！？熱き激闘の火蓋がついに切って落とされる！

ついに迎えた超頂上決戦の日。ペルソナVSゾディアックのバトルを前に、観客は大興奮！しかし、仮面Xのドランブレイブに不正改造の疑いがかかり、仮面X自身も試合出場を停止されてしまう！白星流は絶対に負けない、そのためだったら何だってするはず。オメガの仕業だと直感するテンカだが、ある策略を胸に不敵に笑う…。バトル開始前から大波乱のファーストセット。激しいつばぜり合いの末、果たして勝利を手にするのは！？

ありし日の白星流道場。白星テンカ、露地ランツ、三頭ミリオンは白星訓のもと日々修行に励んでいた。テンカは、白星流最強ブレーダーの証、サムライセイバーを自在に操る師範代であり自身の母、オメガに憧れていた。オメガはXタワーのプロと戦い白星流の強さを証明すべきと訴えるが、掟に背くとして師範から叱責される。そしてある日、道場から突如姿を消す…。母と子が交える一戦の裏に隠された決別の真相が今、明かされる！

九尾ヨウコはペルソナが白星100個に到達できた本当の理由を知っているとほのめかす。その秘密をバラさない代わりに超頂上挑戦者決定戦のサードセットをペルソナに要求した。ソリダスタワー99階チーム「ナインテイルズ」に所属するヨウコは実力的に格上の相手だが、ある奇策を携えたマルチがその勝負を受けて立つ。互いをだまし、化かし合いが交錯するバトル。果たしてマルチの奇策は、格上の相手を翻す一手となるのか！？

超頂上挑戦者決定戦、ファーストセットは仮面Xと一心リュウの対決！クインを破った仮面Xに勝利することで、クインより上位のブレーダーであることを世に知らしめたいと意気込むリュウ。仮面Xの無神経な発言に煽られその闘志はさらに燃え上がる！続くセカンドセットでは悪名高い腐飾ドクガを前に、テンカがバトルの決まり手を堂々と宣言。互いの戦略を読み合う攻防戦の末、相手よりさらに先を見通して勝利を掴むのはどちらか！？