さるお方改め「寿限無寿限無・・・（中略）ビチグソ丸」と絆を深めていく九兵衛。
しかし楽しい時間はそう長くは続かなかった。
将軍家の命によって柳生家を去ったビチグソ丸だったが、九兵衛に会いたい一心で将軍家から逃げ出してしまう。　
必死の捜索の甲斐もなく未だ捕まらないビチグソ丸を諦めず探し続ける九兵衛たちだが・・・。

将軍からの命により、さるお方を預かることになった柳生家。
教育係に指名された九兵衛は将軍家のお役に立てるならと張り切るが、気づくと頭の上にのる子猿が一匹。こちらが「さるお方」だった。
まずは名前を付けようと、お妙と万事屋に協力を仰ぐ九兵衛。将軍家の名に恥じない立派で縁起のいいものをと皆で考えるが･･･

屁怒絽一家と銭湯ではち合わせしてしまった銀時たち。一家は地球侵略をするに違いない！と恐れ、何としてでも風呂場から脱出したい彼らはちびっこ風呂に逃げこむが、実は荼吉尼族は熱いお湯が苦手！結局一緒の風呂に入ることに。行き場を失った銀時たちは、無事風呂場から脱出できるのか？

夜の公園。群がる野次馬の中心でサラリーマンに殴られる一人の男。彼の名は岩松。職業：殴られ屋。人間サンドバックになり客に殴られるのを商売としている元プロボクサーの岩松は、アウトローな街・かぶき町ならイイ稼ぎが出来そうと意気揚々でやってきたが、・・・神楽の一撃を受け後悔する。
自称かぶき町の女王・神楽は、ビビる岩松を殴り屋需要のありそうな場所へ連れ出す。

お登勢からカニを貰い久々の豪華な食卓にテンション高めの万事屋３人。
しかしもらったカニは一杯のみ。ハサミを入れると１０本になる足だが、３人で分けると１本余ってしまう。
それでも仲良く食べようという矢先、食卓が突然停電に！

念願の職を手にした長谷川。今回の仕事は夏休みの大江戸プールでの監視員だ。
自分の役目は子ども達に良い思い出を作らせること！と、熱心な姿勢だったが、・・・同じく監視員の銀時と双眼鏡片手に水着ギャル（彼らがいうところの”デカプリ娘”）の物色を始めてしまう。そしてかぶき町中から、バカが集まってきた！

万事屋へ寺子屋の子ども達が社会見学へ来ることになった。みんなに万事屋の凄さを自慢したい神楽は銀時にカッコイイ所をみせてほしいとせがむ。しかしいざ子ども達を迎え入れると、万事屋の中はなぜか工房に変貌しており、職人面した銀時が何やら怪しいものを製作中。その名も“パトリオット”。はたして万事屋は子ども達の憧れの職業になれるのか？そもそもパトリオットって一体！？

春雨の宇宙要塞に神威率いる第七師団が召集される。彼らが呼び出された理由・・・それは高杉晋助ら鬼兵隊の処理を命じられたためだった。都合良くお互いを利用しあう関係の彼らだが、春雨内部自体も、鬼兵隊も腹に一物あるような連中ばかり。神威と高杉は、お互いの野望のためにどう動くのか？

それぞれ侠の鎖を護るため、ついに再び対峙する銀時と次郎長。
抗争の裏で糸を引いていた華陀率いる辰羅族の兵を相手に獅子奮迅の戦いをするものの、彼らの体力はすでに限界にきていた。
歯を食いしばり立ち上がる次郎長の脳裏にお登勢と辰五郎、３人で過ごした記憶が蘇る・・・

ついにかぶき町が戦乱の渦に。
ピラ子と西郷率いるヤクザ、オカマ軍団は圧倒的な戦力でスナックお登勢を潰しにかかるが、銀時ら４人の抵抗に全く歯がたたない。
善戦する彼らだったが、無情にも万事屋に火の手が上がってしまう。燃え広がる炎に成す術の無い銀時たちの前に、消火の水と共に火消しの辰巳が現れる！次々と馴染みの仲間たちが、かぶき町を護ろうと立ち上がった。