遊☆戯☆王ＡＲＣ-Ｖ

素良が消えたフィールドに残された、遊矢、ユート、そしてバイクに乗って現れた謎のデュエリスト・ユーゴ！ユートは、「融合の手先」ユーゴとデュエルを始めるが、ユーゴはシンクロ召喚を自在に操り、ユートを追いつめて行く。激戦の最中、2人の危険な闘いを止めようと説得する遊矢だが、このデュエルの結末には更なる衝撃が待っていた！

素良とユートを制することができない遊矢は、自らそのデュエルに飛び込む！フィールド上で対峙する遊矢の「オッド・アイズ」とユートの「ダークリベリオン」は共鳴し始めるのだった。一方、自分の想いをユートにぶつける素良に異変が…！動揺する遊矢の前に現れた新たなデュエリスト、その素顔に遊矢はさらなる衝撃を受けるのだった！

黒咲に敗れ、医務室で治療を受ける素良。しかし医務室を抜け出し、素良とユート、それぞれの想いがデュエルでぶつかり合う！姿を消した素良を捜していた遊矢は、2人のデュエルを止めようとするが、無情にもその手は振り払われてしまう。融合とエクシーズ、2つの世界を取り巻く実態が、デュエルによって今、明らかに…!!

黒咲の「レイド・ラプターズ」によって、モンスターを全滅にまで追い込まれた素良。新たな融合モンスターを召喚し猛攻を仕掛けるが、黒咲の戦略はその上を行っていた…！次々とモンスターを破壊される素良の表情に次第に焦りの色が…。遊矢たちが見たこともない、素良の「本気」が顔を出す…！！

熱戦がつづく舞網チャンピオンシップ一回戦。ついに素良の出番である。その対戦相手は、謎に包まれたエクシーズ使いの黒咲隼。選ばれたフィールド「未来都市ハートランド」の名に、黒咲はわずかながら動揺を見せる。いっぽう素良はいつものマイペースで黒咲を挑発しつつ、融合召喚を成功。一進一退のデュエルが続く中、黒咲は過去に自分が見た「戦場」について語りはじめる…。

「ペンデュラム召喚がお前を敗北に導く！」沢渡の言葉通り、ペンデュラム召喚を封じられ、追いつめられる遊矢。遊矢のエンタメデッキと沢渡の妖仙獣デッキが繰り広げるデュエルは、まさしくエンタメデュエル！このペンデュラム対決に、観客は最高の盛り上がりを見せていた。その声を背に、2人のデュエリストも最大限の力でぶつかり合う！

舞網チャンピオンシップ、いよいよ遊矢の初戦！相手はネオ改め、「ネオ・ニュー沢渡シンゴ」！進化した遊矢のペンデュラムデッキに対抗し、沢渡もまた新たに「妖仙獣」デッキを手に、憎きライバル・遊矢に戦いを挑むのだった！遊矢のペンデュラム召喚を目の当たりにし、大いに沸く観客たち。ここから沢渡の「伝説のリベンジデュエル」が幕をあける！

柚子に続けと、権現坂の選手権一回戦が幕をあける！相手はかつての兄弟子・暗国寺ゲン。親友の遊矢と自分を侮辱した相手に負ける訳にはいかないと、息をまく権現坂。しかしその会場に遊矢の姿はなかった。暗国寺は卑劣な手段で、遊矢と権現坂を罠にはめようとしていた！遊矢の危機に、権現坂の心が揺れる…！

遊矢たち遊勝塾メンバーが見守る中、柚子vs真澄のデュエルが始まる！
かつての遊勝塾vsLDS戦で真澄に敗北した柚子は、その悔しさから素良に「融合召喚」を学び、力をつけてきた。これまでの成果を発揮する柚子を尻目に、真澄は「真のエースモンスター」を召喚し、力の差を見せつける…！

遊勝塾の一番手・フトシが順調に勝利し、次はアユの試合の応援に向かう遊矢たち。
アユの相手は「LDSの秘蔵っ子」といわれる零羅。皆の応援を受けはりきるアユとは対照的に、零羅は何かにおびえているようだった。LDS理事長・赤馬日美香が見守る中、零羅はアユのモンスターをコピーするというなんとも不気味な戦略を繰り出す。