テレビでオタク100人を集めた討論番組が放送される。出演者の中には、アイドル・寺門通の親衛隊隊長を務める新八の姿も。各々の持論でスタジオ内が白熱する中、1人の男が新八と激しい議論を戦わせる。その男は、妖刀の呪いでオタクと化し、真選組を追われた土方だった。変わり果てた土方と対面した銀時たちは、妖刀に秘められた恐ろしい過去を知る。一方、真選組内では伊東の権力が急激に拡大し、隊士たちに不穏な空気が流れ始めていた。

ぼろぼろになった愛刀を預けに鍛冶屋を訪ねた土方は、店長の忠告を無視して妖刀と呼ばれる刀を持ち帰ってしまう。その後、真選組屯所へ向かう道中に浪士の集団にからまれ、早速新しい刀の試し斬りをしようとする土方。しかし刀を手にした途端、妖刀の呪いでなぜか恐ろしいほどに軟弱化してしまう！絶体絶命のピンチに陥った土方を救ったのは、１年ぶりに江戸に戻ってきた真選組参謀・伊東鴨太郎だった。

電車の中で漫画雑誌を読みふけていた銀時は、連載中の漫画「ギンタマン」を酷評。するとそのそばには「ギンタマン」の担当編集者の姿が…。銀時のあまりの暴言に怒り狂った彼は、担当としての怒りと仕事の愚痴を爆発させる。それを聞いた銀時は「ギンタマン」を面白い漫画にするため、自ら担当編集者となって漫画家に会いに行くことに…。

ヨドバツカメラの店長の提案で、ＯＷｅｅを手に入れるためのゲーム勝負に挑む２チームの男たち。ひとつは銀時と桂たちのチーム、もうひとつは真選組のチームである。一戦目はギャルゲー対決。「バキボキメモリアル」の主人公になって、ヒロインの女の子を先に落とした方が勝ちだ。しかしヒロインのマグ子は、朝食に食パンじゃなくてカジキマグロをくわえて登校するような女の子。一筋縄ではいかないのだった。そして二戦目のパズルゲーム対決も波乱の末、最終戦へ…。

オタクの聖地・秋葉原に、熱きオタクたちが大集結した。なぜから今日、新型ゲーム機、弁天堂ＯＷｅｅが発売されるからだ。しかしＯＷｅｅは先着百名にしか行き届かないらしく長い順番待ちの列ができている。万事屋の銀時たちも依頼を受けて買いに来た。何とか列の前の方に進もうとあざとい策をねる銀時たち。列の中には桂やエリザベス、お妙から依頼された真選組の面々もいて、ゲーム機を手に入れるための熾烈な戦いが始まった…。

「昔の武勇伝は三割増で話せ　盛り上がればいいんだよ盛り上がれば」
スナックお登勢のキャサリンは、昔は全銀河のお宝を荒らし回り、どんな厳重な金庫も容易にこじ開け“鍵っこキャサリン”と呼ばれていた。しかし今では、店の金を一度盗んだにも関わらず再雇用してくれたお登勢に深く感謝し、カタギの道を歩んでいる。そんなキャサリンの前に、昔の泥棒仲間クリカンが現れて「お前の力が借りたい」と誘った…。
「花屋とかケーキ屋の娘に男は弱い」
万事屋に浮気調査の依頼が来た。依頼人みち子によれば、彼女の旦那は最近毎晩帰りが遅く、着物から香水の匂いがするという。しかし旦那には意外な秘密が…。

無限に広がる宇宙。その中に、外部からの侵略を受けて滅亡する寸前の星があった。ほとんどの住人が抵抗を諦めた中、その星をなんとか救おうとする最後のふたりがいた。そのふたりが助けを求めた相手とは“宇宙の救世主”“宇宙を駆ける伝説の掃除屋”“最強のエイリアンバスター”などの異名を持つ星海坊主！宇宙最強のその男は、しかし…ヅラだった。そしてヅラにまつわる言葉に、ことのほかデリケートなのだった。人々が星海坊主に期待と不信感を寄せる中、その星の真実の歴史が明らかに…。

痴漢で誤認逮捕された長谷川の前に現れたのは、ハツの恋人を名乗る男・破牙だった。しかも彼はやり手の検事であり、今回の痴漢事件の裁判で被害者の弁護をするという。その立場を利用し、「おとなしくハツとの離婚届に判を押せば無罪、逆らえば有罪」と持ちかける破牙。すっかり人生に絶望し、打ちひしがれる長谷川だったが、銀時の励ましで最後まで破牙と戦う決意を固める。

“マダオ”（まるでダメなオッサン）こと長谷川は、ようやく決めた再就職をきっかけに別居中の妻・ハツと関係を戻そうと考える。ただ、彼にはひとつだけ気がかりなことがあった。ハツとの電話中に、知らない男の声が聞こえてきたのだ。銀時に浮気調査を依頼した長谷川だが、その帰り道に不運が重なり痴漢容疑で誤認逮捕されてしまう。留置所に拘留された長谷川を訪ねた銀時は、調査の結果を報告するが…。

今年もバレンタインデーがやってきた。江戸の町中で乙女たちがチョコレートを買いまくっている。万事屋には、「バレンタインなんて興味ない」と言いつつも、気合満々のファッションを決めた銀時と新八の姿が。そんな時、突然空から巨大なチョコレートが降ってくる。そのチョコは、宇宙を守る正義のヒーロー・スペースウーマンが落としたものだった。「ヒーローがバレンタイン！？」と不思議がる一同だが、どうやら彼女はある悩みを抱えているようで…。