ロミオが「吸い込みスイスイ」を使い、町にあるものを吸い込み始めた。スクールバスやアウル・グライダーまで狙っている。モンキー・グーのイタズラに手を焼いていたコナーたちは、モンキー・グーを空飛ぶ工場で暴れさせ、その隙をついてロミオを止める作戦を考えた。

町に来たモンキー・グーは早速楽しく遊び始める。パジャマスクの言うことなど聞くわけがない。グレッグはただの面白いサルだと言うが、コナーとアマヤはモンキー・グーを解放したグレッグを責めてしまい・・・。

謎の山の塔から、モンキー・グーの像が消えた。アン・ユーはパジャマスクに助けを求め、みんなで像を探す。だが塔で見張りをしていたグレッグが、像に封印されたイタズラなサル モンキー・グーをうっかり解放してしまう。

空飛ぶ工場が暴れ出し、町をビームで撃ちまくる。どうやらロボットが反乱を起こしたらしい。どうしようもなくなったロミオは、パジャマスクに助けを求めてくるのだった。

「小惑星を触らないように」と言ったことがきっかけで、ニュートンとアマヤの仲が少しギクシャクした。それを見たロミオは、アマヤと小惑星が写った写真をでっち上げてきて・・・。

悪者と戦うのが苦手なニュートン。だがコナーたちは、パワーを使ってヒーローになるように言う。夜になり、宇宙に行く前に町を見回ったニュートンの前に、年老いたニンジャが現れた。

ロミオが怪しい宇宙マシンを作っている。パジャマスクは、悪者との戦いは苦手だというニュートンに頼み込んで、そのマシンについて調べてもらうことにした。

図書館で再びニュートンと出会ったコナーたちは、大喜びで話しかけ、夜にまた宇宙で会う約束をした。だが興奮して質問責めにするパジャマスクにニュートンは口を閉ざしてしまって・・・。

宇宙での任務から戻る途中、いきなり目の前に小惑星が飛び出してきた。アマヤが避けきれずにぶつかったせいで、小惑星は地球に落下してしまう。公園に落ちたその岩は、謎のパワーを持っていたのだ。

新しいキャット・カーとアウル・グライダーとゲッコー・モービルを合体させるとかっこいいパジャ・ジェットになる。その試験飛行を見たアルマジランは、自分もジェット機が欲しくなった。そこでパジャマスクに貸してくれと頼んできて・・・。