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ズウィージョウの居場所を知らないかとユウディアスに詰め寄るマナブ。どうやら先日起きたムツバケーブルテレビでの騒動にズウィージョウが関係しているらしい…。己の無力さを痛感し、自分を鍛え直したいというユウディアスに、マニャが提案する地獄の特訓とは!?

ムツバケーブルテレビのスタジオに乱入し、デュエルさせろと暴れるチュパ太郎。心配したユウディアスは対戦相手を買って出る。しかし、チュパ太郎が『魔法羊女(まほうようじょ)メェ～グちゃん』を召喚した瞬間、デュエルディスクから妖しい光が溢れ出し…。

安立マニャちゃんチームと御当地小学生チームのラッシュデュエル対決、第２戦の対戦相手としてマニャに指名されたのは、なんと、客席にいた蒼月マナブ！そして、そのマナブの対戦相手として現れたデュエリストは…、な、なんと！マニャの愛犬、ボチであった！

ムツバケーブルテレビ唯一の人気番組、『楽しく学べる・最強ゴーラッシュ！』に天才子役の安立(あたち)マニャがやってくる！マニャの幼なじみとしてデュエルの対戦役を頼まれた遊歩だったが、５年ぶりに再会したマニャの変わりように戸惑いを隠せずにいた。

自分の未熟さを感じたユウディアスは、ラッシュデュエルの特訓をして欲しいと遊飛に申し込む。特訓メカと特訓ＣＤを駆使してユウディアスを鍛える遊飛。次々と問題を解いていくユウディアス。一見、順調そうに見えた特訓だったが、特訓メカが暴走しはじめ…。

ズウィージョウの行方を追う遊飛たちだったが、気付けば今月の収入はゼロ…。ＵＴＳの評判を上げようと、子どもたちが恐れる都市伝説の真相を突き止めることに。都市伝説の一つ“３メートルさん”を探すユウディアスは、廃工場の中で不思議な椅子を発見する。

クリーニングに出した服がびしょ濡れだったことに怒り、店長に詰め寄る遊飛。だが、その店長こそ遊飛のアースダマーを奪った宇宙人、合羽井(かわい)テルだった！合羽井にデュエルを挑む遊飛！しかし、濡れたデュエルディスクが壊れて動かなくなってしまい…。

チュパ太郎(たろう)にそそのかされ、集積所へと連れてこられたユウディアス。持ち前の身体能力でチュパ太郎が仕掛ける罠を次々と突破するユウディアスだったが、ついに捕らえられて絶体絶命のピンチに陥ってしまう。一方、慌てた様子の遊飛も集積所に現れ…。

六葉町で次々と巻き起こる襲撃事件。ある者はカードを眺めているときに、また、ある者はイラストを描き上げたときに、そして、ＵＴＳの八木(やぎ)さんまでもが犯人の毒牙にかかってしまう。一見、なんの関連も無さそうな被害者たちの、意外な共通点とは…。

ＵＴＳを訪れた新たな依頼人。しかし、その依頼人の正体は“ＭＩＫ”こと迷惑異星人監視機構所属のエージェント、蒼月(そうげつ)マナブだった！不法滞在迷惑異星人として投降を求められたユウディアスは、自らの自由を懸けてマナブとデュエルをすることに!