ゆで太郎の人気の秘密が店内の製麺機で打つ本格的なそば。一般的な立ち食いそば店が、そば粉2～4割なのに対し、ゆで太郎は5.5割と町のそば店と変わらないクオリティ。脇役の食材にもこだわり、海苔は播磨灘の一番摘みを使用。他にも、わさびは安曇野の本わさび、鰹節には鹿児島・枕崎の枯節など、厳選したものを使用している。それでいて、もり・かけそばが430円という立ち食いそば店並みの価格で提供され、リピーターが続出している。また朝は朝食限定のセットメニューを500円前後で提供。夕方以降は店舗に併設したもつ煮専門店「もつ次郎」が人気になるなど、幅広い時間帯で客を呼び込み売上げを伸ばしている。さらに出店戦略にも特徴がある。立ち食いそば店の多くが駅周辺やオフィス街に出店するのに対し、ゆで太郎は郊外を中心に出店。家族連れやシニアにも客層を広げ、店舗を拡大。そばチェーンで店舗数1位にまで躍進しているのだ。

ゆで太郎システムを率いるのは社長の池田智昭。もともと「ほっかほっか亭」のFCオーナーから、本部の取締役にまで上りつめた異例のキャリアの持ち主だ。一方、ゆで太郎は1994年、元ほっかほっか亭のFCオーナーで、そば職人だった水信春夫氏が創業。自家製麺の立ち食いそば店として人気を博していた。2003年にほっかほっか亭を退職した池田は新たな事業を模索する中で、ゆで太郎に注目。ところが当時のゆで太郎はそば職人が一人ですべてを切り盛りし、オペレーションに問題を抱えていた。これを見た池田はそば職人のそばづくりをマニュアル化すれば、必ず大きなビジネスになると考え、水信氏の「信越食品」とマスターフランチャイズ経営を締結。ほっかほっか亭のノウハウでそば作りをマニュアル化し、都心の立ち食い店から、郊外の誰もが入りやすい店へと変えることで、ゆで太郎を業界1位へと導いたのだ。